Protein–RNA interactions for Protein: Q6DN14

MCTP1, Multiple C2 and transmembrane domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 999 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCTP1Q6DN14 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MCTP1Q6DN14 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MCTP1Q6DN14 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
MCTP1Q6DN14 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MCTP1Q6DN14 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MCTP1Q6DN14 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MCTP1Q6DN14 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
MCTP1Q6DN14 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MCTP1Q6DN14 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MCTP1Q6DN14 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MCTP1Q6DN14 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MCTP1Q6DN14 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MCTP1Q6DN14 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
MCTP1Q6DN14 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MCTP1Q6DN14 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MCTP1Q6DN14 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MCTP1Q6DN14 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MCTP1Q6DN14 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MCTP1Q6DN14 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MCTP1Q6DN14 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MCTP1Q6DN14 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MCTP1Q6DN14 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MCTP1Q6DN14 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MCTP1Q6DN14 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MCTP1Q6DN14 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MCTP1Q6DN14 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MCTP1Q6DN14 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MCTP1Q6DN14 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MCTP1Q6DN14 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MCTP1Q6DN14 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MCTP1Q6DN14 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MCTP1Q6DN14 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MCTP1Q6DN14 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MCTP1Q6DN14 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MCTP1Q6DN14 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MCTP1Q6DN14 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MCTP1Q6DN14 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MCTP1Q6DN14 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MCTP1Q6DN14 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MCTP1Q6DN14 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MCTP1Q6DN14 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MCTP1Q6DN14 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MCTP1Q6DN14 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MCTP1Q6DN14 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MCTP1Q6DN14 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MCTP1Q6DN14 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MCTP1Q6DN14 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MCTP1Q6DN14 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MCTP1Q6DN14 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MCTP1Q6DN14 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MCTP1Q6DN14 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MCTP1Q6DN14 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MCTP1Q6DN14 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MCTP1Q6DN14 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MCTP1Q6DN14 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MCTP1Q6DN14 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MCTP1Q6DN14 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MCTP1Q6DN14 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
MCTP1Q6DN14 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MCTP1Q6DN14 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MCTP1Q6DN14 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MCTP1Q6DN14 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MCTP1Q6DN14 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MCTP1Q6DN14 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
MCTP1Q6DN14 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MCTP1Q6DN14 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MCTP1Q6DN14 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MCTP1Q6DN14 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MCTP1Q6DN14 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MCTP1Q6DN14 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MCTP1Q6DN14 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MCTP1Q6DN14 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MCTP1Q6DN14 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MCTP1Q6DN14 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MCTP1Q6DN14 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MCTP1Q6DN14 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MCTP1Q6DN14 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MCTP1Q6DN14 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MCTP1Q6DN14 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MCTP1Q6DN14 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MCTP1Q6DN14 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MCTP1Q6DN14 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MCTP1Q6DN14 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MCTP1Q6DN14 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MCTP1Q6DN14 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MCTP1Q6DN14 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MCTP1Q6DN14 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MCTP1Q6DN14 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MCTP1Q6DN14 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MCTP1Q6DN14 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MCTP1Q6DN14 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
MCTP1Q6DN14 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MCTP1Q6DN14 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MCTP1Q6DN14 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MCTP1Q6DN14 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MCTP1Q6DN14 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MCTP1Q6DN14 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MCTP1Q6DN14 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MCTP1Q6DN14 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MCTP1Q6DN14 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms