Protein–RNA interactions for Protein: Q17RB0

RTL8B, Retrotransposon Gag-like protein 8B, humanhuman

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL8BQ17RB0 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RTL8BQ17RB0 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RTL8BQ17RB0 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RTL8BQ17RB0 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RTL8BQ17RB0 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RTL8BQ17RB0 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RTL8BQ17RB0 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RTL8BQ17RB0 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RTL8BQ17RB0 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RTL8BQ17RB0 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RTL8BQ17RB0 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RTL8BQ17RB0 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RTL8BQ17RB0 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RTL8BQ17RB0 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RTL8BQ17RB0 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RTL8BQ17RB0 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RTL8BQ17RB0 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RTL8BQ17RB0 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RTL8BQ17RB0 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RTL8BQ17RB0 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RTL8BQ17RB0 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RTL8BQ17RB0 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RTL8BQ17RB0 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RTL8BQ17RB0 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RTL8BQ17RB0 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RTL8BQ17RB0 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RTL8BQ17RB0 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
RTL8BQ17RB0 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RTL8BQ17RB0 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RTL8BQ17RB0 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
RTL8BQ17RB0 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RTL8BQ17RB0 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RTL8BQ17RB0 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RTL8BQ17RB0 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RTL8BQ17RB0 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RTL8BQ17RB0 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RTL8BQ17RB0 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RTL8BQ17RB0 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
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RTL8BQ17RB0 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RTL8BQ17RB0 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RTL8BQ17RB0 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RTL8BQ17RB0 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
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RTL8BQ17RB0 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RTL8BQ17RB0 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RTL8BQ17RB0 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RTL8BQ17RB0 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RTL8BQ17RB0 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
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RTL8BQ17RB0 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
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RTL8BQ17RB0 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
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RTL8BQ17RB0 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
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RTL8BQ17RB0 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RTL8BQ17RB0 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RTL8BQ17RB0 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
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RTL8BQ17RB0 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
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RTL8BQ17RB0 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
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RTL8BQ17RB0 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RTL8BQ17RB0 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RTL8BQ17RB0 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RTL8BQ17RB0 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RTL8BQ17RB0 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
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RTL8BQ17RB0 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RTL8BQ17RB0 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RTL8BQ17RB0 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RTL8BQ17RB0 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RTL8BQ17RB0 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
RTL8BQ17RB0 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RTL8BQ17RB0 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RTL8BQ17RB0 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
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