Protein–RNA interactions for Protein: Q16878

CDO1, Cysteine dioxygenase type 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDO1Q16878 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
CDO1Q16878 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
CDO1Q16878 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
CDO1Q16878 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
CDO1Q16878 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
CDO1Q16878 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
CDO1Q16878 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
CDO1Q16878 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
CDO1Q16878 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
CDO1Q16878 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CDO1Q16878 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CDO1Q16878 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CDO1Q16878 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
CDO1Q16878 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CDO1Q16878 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
CDO1Q16878 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
CDO1Q16878 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CDO1Q16878 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
CDO1Q16878 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
CDO1Q16878 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CDO1Q16878 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CDO1Q16878 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CDO1Q16878 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
CDO1Q16878 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
CDO1Q16878 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
CDO1Q16878 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
CDO1Q16878 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CDO1Q16878 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
CDO1Q16878 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CDO1Q16878 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CDO1Q16878 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CDO1Q16878 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
CDO1Q16878 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
CDO1Q16878 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CDO1Q16878 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
CDO1Q16878 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CDO1Q16878 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CDO1Q16878 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CDO1Q16878 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CDO1Q16878 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CDO1Q16878 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CDO1Q16878 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CDO1Q16878 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CDO1Q16878 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CDO1Q16878 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CDO1Q16878 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CDO1Q16878 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
CDO1Q16878 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CDO1Q16878 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CDO1Q16878 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CDO1Q16878 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CDO1Q16878 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CDO1Q16878 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CDO1Q16878 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CDO1Q16878 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CDO1Q16878 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CDO1Q16878 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CDO1Q16878 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CDO1Q16878 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CDO1Q16878 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CDO1Q16878 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
CDO1Q16878 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CDO1Q16878 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CDO1Q16878 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CDO1Q16878 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
CDO1Q16878 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
CDO1Q16878 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CDO1Q16878 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CDO1Q16878 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CDO1Q16878 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CDO1Q16878 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
CDO1Q16878 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CDO1Q16878 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
CDO1Q16878 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CDO1Q16878 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
CDO1Q16878 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
CDO1Q16878 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CDO1Q16878 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
CDO1Q16878 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
CDO1Q16878 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
CDO1Q16878 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.72■□□□□ 0.75
CDO1Q16878 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CDO1Q16878 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CDO1Q16878 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CDO1Q16878 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CDO1Q16878 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CDO1Q16878 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CDO1Q16878 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CDO1Q16878 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CDO1Q16878 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CDO1Q16878 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CDO1Q16878 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CDO1Q16878 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CDO1Q16878 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
CDO1Q16878 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CDO1Q16878 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CDO1Q16878 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CDO1Q16878 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CDO1Q16878 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CDO1Q16878 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
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