Protein–RNA interactions for Protein: Q13562

NEUROD1, Neurogenic differentiation factor 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEUROD1Q13562 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
NEUROD1Q13562 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
NEUROD1Q13562 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
NEUROD1Q13562 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
NEUROD1Q13562 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
NEUROD1Q13562 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
NEUROD1Q13562 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
NEUROD1Q13562 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
NEUROD1Q13562 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
NEUROD1Q13562 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
NEUROD1Q13562 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
NEUROD1Q13562 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
NEUROD1Q13562 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
NEUROD1Q13562 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
NEUROD1Q13562 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
NEUROD1Q13562 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
NEUROD1Q13562 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
NEUROD1Q13562 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
NEUROD1Q13562 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
NEUROD1Q13562 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
NEUROD1Q13562 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
NEUROD1Q13562 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
NEUROD1Q13562 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
NEUROD1Q13562 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
NEUROD1Q13562 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
NEUROD1Q13562 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
NEUROD1Q13562 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
NEUROD1Q13562 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
NEUROD1Q13562 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
NEUROD1Q13562 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
NEUROD1Q13562 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC27.73■■■□□ 2.03
NEUROD1Q13562 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
NEUROD1Q13562 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
NEUROD1Q13562 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC27.73■■■□□ 2.03
NEUROD1Q13562 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
NEUROD1Q13562 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
NEUROD1Q13562 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
NEUROD1Q13562 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
NEUROD1Q13562 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
NEUROD1Q13562 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
NEUROD1Q13562 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
NEUROD1Q13562 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
NEUROD1Q13562 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
NEUROD1Q13562 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
NEUROD1Q13562 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
NEUROD1Q13562 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
NEUROD1Q13562 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
NEUROD1Q13562 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
NEUROD1Q13562 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
NEUROD1Q13562 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
NEUROD1Q13562 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
NEUROD1Q13562 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
NEUROD1Q13562 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
NEUROD1Q13562 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
NEUROD1Q13562 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
NEUROD1Q13562 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
NEUROD1Q13562 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC27.72■■■□□ 2.03
NEUROD1Q13562 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
NEUROD1Q13562 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
NEUROD1Q13562 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
NEUROD1Q13562 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC27.72■■■□□ 2.03
NEUROD1Q13562 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
NEUROD1Q13562 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
NEUROD1Q13562 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
NEUROD1Q13562 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
NEUROD1Q13562 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
NEUROD1Q13562 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
NEUROD1Q13562 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
NEUROD1Q13562 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
NEUROD1Q13562 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
NEUROD1Q13562 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
NEUROD1Q13562 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
NEUROD1Q13562 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
NEUROD1Q13562 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
NEUROD1Q13562 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
NEUROD1Q13562 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
NEUROD1Q13562 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
NEUROD1Q13562 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
NEUROD1Q13562 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
NEUROD1Q13562 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
NEUROD1Q13562 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
NEUROD1Q13562 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
NEUROD1Q13562 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC27.71■■■□□ 2.03
NEUROD1Q13562 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
NEUROD1Q13562 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
NEUROD1Q13562 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
NEUROD1Q13562 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
NEUROD1Q13562 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
NEUROD1Q13562 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
NEUROD1Q13562 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
NEUROD1Q13562 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
NEUROD1Q13562 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
NEUROD1Q13562 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
NEUROD1Q13562 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
NEUROD1Q13562 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
NEUROD1Q13562 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
NEUROD1Q13562 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
NEUROD1Q13562 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
NEUROD1Q13562 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
NEUROD1Q13562 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
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