Protein–RNA interactions for Protein: Q12792

TWF1, Twinfilin-1, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TWF1Q12792 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
TWF1Q12792 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
TWF1Q12792 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
TWF1Q12792 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
TWF1Q12792 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
TWF1Q12792 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
TWF1Q12792 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
TWF1Q12792 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
TWF1Q12792 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
TWF1Q12792 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
TWF1Q12792 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
TWF1Q12792 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
TWF1Q12792 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
TWF1Q12792 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
TWF1Q12792 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC19.77■□□□□ 0.76
TWF1Q12792 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.77■□□□□ 0.76
TWF1Q12792 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
TWF1Q12792 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
TWF1Q12792 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
TWF1Q12792 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.75
TWF1Q12792 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
TWF1Q12792 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
TWF1Q12792 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
TWF1Q12792 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
TWF1Q12792 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
TWF1Q12792 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
TWF1Q12792 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
TWF1Q12792 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
TWF1Q12792 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
TWF1Q12792 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC19.76■□□□□ 0.75
TWF1Q12792 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
TWF1Q12792 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
TWF1Q12792 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
TWF1Q12792 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
TWF1Q12792 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
TWF1Q12792 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
TWF1Q12792 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
TWF1Q12792 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
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TWF1Q12792 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
TWF1Q12792 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
TWF1Q12792 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
TWF1Q12792 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
TWF1Q12792 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
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TWF1Q12792 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
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TWF1Q12792 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
TWF1Q12792 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
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TWF1Q12792 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
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TWF1Q12792 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
TWF1Q12792 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
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TWF1Q12792 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
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TWF1Q12792 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
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TWF1Q12792 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
TWF1Q12792 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
TWF1Q12792 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
TWF1Q12792 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
TWF1Q12792 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
TWF1Q12792 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
TWF1Q12792 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
TWF1Q12792 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
TWF1Q12792 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
TWF1Q12792 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
TWF1Q12792 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
TWF1Q12792 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC19.74■□□□□ 0.75
TWF1Q12792 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
TWF1Q12792 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
TWF1Q12792 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
TWF1Q12792 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
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