Protein–RNA interactions for Protein: Q08AH1

ACSM1, Acyl-coenzyme A synthetase ACSM1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 577 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACSM1Q08AH1 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ACSM1Q08AH1 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ACSM1Q08AH1 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ACSM1Q08AH1 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ACSM1Q08AH1 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ACSM1Q08AH1 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
ACSM1Q08AH1 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ACSM1Q08AH1 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ACSM1Q08AH1 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ACSM1Q08AH1 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ACSM1Q08AH1 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ACSM1Q08AH1 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ACSM1Q08AH1 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ACSM1Q08AH1 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ACSM1Q08AH1 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ACSM1Q08AH1 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
ACSM1Q08AH1 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ACSM1Q08AH1 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ACSM1Q08AH1 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ACSM1Q08AH1 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ACSM1Q08AH1 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ACSM1Q08AH1 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
ACSM1Q08AH1 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ACSM1Q08AH1 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ACSM1Q08AH1 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ACSM1Q08AH1 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ACSM1Q08AH1 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ACSM1Q08AH1 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ACSM1Q08AH1 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ACSM1Q08AH1 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ACSM1Q08AH1 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ACSM1Q08AH1 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ACSM1Q08AH1 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ACSM1Q08AH1 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ACSM1Q08AH1 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ACSM1Q08AH1 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ACSM1Q08AH1 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ACSM1Q08AH1 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ACSM1Q08AH1 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ACSM1Q08AH1 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ACSM1Q08AH1 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ACSM1Q08AH1 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ACSM1Q08AH1 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ACSM1Q08AH1 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ACSM1Q08AH1 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ACSM1Q08AH1 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ACSM1Q08AH1 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ACSM1Q08AH1 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ACSM1Q08AH1 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ACSM1Q08AH1 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ACSM1Q08AH1 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ACSM1Q08AH1 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.26
ACSM1Q08AH1 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
ACSM1Q08AH1 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ACSM1Q08AH1 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ACSM1Q08AH1 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ACSM1Q08AH1 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ACSM1Q08AH1 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ACSM1Q08AH1 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ACSM1Q08AH1 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ACSM1Q08AH1 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ACSM1Q08AH1 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ACSM1Q08AH1 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ACSM1Q08AH1 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ACSM1Q08AH1 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
ACSM1Q08AH1 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ACSM1Q08AH1 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ACSM1Q08AH1 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ACSM1Q08AH1 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ACSM1Q08AH1 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ACSM1Q08AH1 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ACSM1Q08AH1 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
ACSM1Q08AH1 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ACSM1Q08AH1 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ACSM1Q08AH1 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ACSM1Q08AH1 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ACSM1Q08AH1 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ACSM1Q08AH1 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ACSM1Q08AH1 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ACSM1Q08AH1 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ACSM1Q08AH1 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ACSM1Q08AH1 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ACSM1Q08AH1 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ACSM1Q08AH1 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ACSM1Q08AH1 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ACSM1Q08AH1 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ACSM1Q08AH1 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ACSM1Q08AH1 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ACSM1Q08AH1 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ACSM1Q08AH1 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ACSM1Q08AH1 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ACSM1Q08AH1 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ACSM1Q08AH1 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ACSM1Q08AH1 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ACSM1Q08AH1 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ACSM1Q08AH1 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ACSM1Q08AH1 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ACSM1Q08AH1 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ACSM1Q08AH1 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ACSM1Q08AH1 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms