Protein–RNA interactions for Protein: Q03721

KCNC4, Potassium voltage-gated channel subfamily C member 4, humanhuman

Predictions only

Length 635 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNC4Q03721 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
KCNC4Q03721 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
KCNC4Q03721 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
KCNC4Q03721 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
KCNC4Q03721 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
KCNC4Q03721 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
KCNC4Q03721 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
KCNC4Q03721 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
KCNC4Q03721 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
KCNC4Q03721 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
KCNC4Q03721 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
KCNC4Q03721 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
KCNC4Q03721 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
KCNC4Q03721 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
KCNC4Q03721 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
KCNC4Q03721 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
KCNC4Q03721 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
KCNC4Q03721 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
KCNC4Q03721 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
KCNC4Q03721 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
KCNC4Q03721 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
KCNC4Q03721 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
KCNC4Q03721 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
KCNC4Q03721 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
KCNC4Q03721 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
KCNC4Q03721 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
KCNC4Q03721 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
KCNC4Q03721 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
KCNC4Q03721 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
KCNC4Q03721 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
KCNC4Q03721 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
KCNC4Q03721 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
KCNC4Q03721 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
KCNC4Q03721 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
KCNC4Q03721 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
KCNC4Q03721 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
KCNC4Q03721 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
KCNC4Q03721 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC18.16■□□□□ 0.5
KCNC4Q03721 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
KCNC4Q03721 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
KCNC4Q03721 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
KCNC4Q03721 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
KCNC4Q03721 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
KCNC4Q03721 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
KCNC4Q03721 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
KCNC4Q03721 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
KCNC4Q03721 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
KCNC4Q03721 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
KCNC4Q03721 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
KCNC4Q03721 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
KCNC4Q03721 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
KCNC4Q03721 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
KCNC4Q03721 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
KCNC4Q03721 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
KCNC4Q03721 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
KCNC4Q03721 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
KCNC4Q03721 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
KCNC4Q03721 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
KCNC4Q03721 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
KCNC4Q03721 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
KCNC4Q03721 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
KCNC4Q03721 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
KCNC4Q03721 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
KCNC4Q03721 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
KCNC4Q03721 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
KCNC4Q03721 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
KCNC4Q03721 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
KCNC4Q03721 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
KCNC4Q03721 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
KCNC4Q03721 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
KCNC4Q03721 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
KCNC4Q03721 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
KCNC4Q03721 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
KCNC4Q03721 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
KCNC4Q03721 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
KCNC4Q03721 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
KCNC4Q03721 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
KCNC4Q03721 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
KCNC4Q03721 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
KCNC4Q03721 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
KCNC4Q03721 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
KCNC4Q03721 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
KCNC4Q03721 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
KCNC4Q03721 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
KCNC4Q03721 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
KCNC4Q03721 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
KCNC4Q03721 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
KCNC4Q03721 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
KCNC4Q03721 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
KCNC4Q03721 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
KCNC4Q03721 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
KCNC4Q03721 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
KCNC4Q03721 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
KCNC4Q03721 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
KCNC4Q03721 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
KCNC4Q03721 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
KCNC4Q03721 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
KCNC4Q03721 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
KCNC4Q03721 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
KCNC4Q03721 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms