Protein–RNA interactions for Protein: P98194

ATP2C1, Calcium-transporting ATPase type 2C member 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2C1P98194 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATP2C1P98194 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
ATP2C1P98194 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATP2C1P98194 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATP2C1P98194 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATP2C1P98194 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATP2C1P98194 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATP2C1P98194 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATP2C1P98194 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
ATP2C1P98194 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATP2C1P98194 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATP2C1P98194 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATP2C1P98194 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATP2C1P98194 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATP2C1P98194 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
ATP2C1P98194 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATP2C1P98194 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
ATP2C1P98194 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATP2C1P98194 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATP2C1P98194 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATP2C1P98194 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ATP2C1P98194 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ATP2C1P98194 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ATP2C1P98194 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ATP2C1P98194 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ATP2C1P98194 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ATP2C1P98194 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ATP2C1P98194 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ATP2C1P98194 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ATP2C1P98194 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ATP2C1P98194 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
ATP2C1P98194 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ATP2C1P98194 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ATP2C1P98194 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
ATP2C1P98194 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ATP2C1P98194 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ATP2C1P98194 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ATP2C1P98194 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ATP2C1P98194 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ATP2C1P98194 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ATP2C1P98194 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ATP2C1P98194 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ATP2C1P98194 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ATP2C1P98194 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ATP2C1P98194 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ATP2C1P98194 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ATP2C1P98194 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ATP2C1P98194 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ATP2C1P98194 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ATP2C1P98194 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ATP2C1P98194 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ATP2C1P98194 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ATP2C1P98194 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
ATP2C1P98194 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ATP2C1P98194 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ATP2C1P98194 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ATP2C1P98194 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ATP2C1P98194 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ATP2C1P98194 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ATP2C1P98194 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ATP2C1P98194 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ATP2C1P98194 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ATP2C1P98194 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ATP2C1P98194 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ATP2C1P98194 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ATP2C1P98194 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ATP2C1P98194 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ATP2C1P98194 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ATP2C1P98194 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ATP2C1P98194 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ATP2C1P98194 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ATP2C1P98194 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ATP2C1P98194 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ATP2C1P98194 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ATP2C1P98194 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
ATP2C1P98194 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ATP2C1P98194 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ATP2C1P98194 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ATP2C1P98194 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
ATP2C1P98194 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ATP2C1P98194 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ATP2C1P98194 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ATP2C1P98194 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ATP2C1P98194 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ATP2C1P98194 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ATP2C1P98194 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ATP2C1P98194 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ATP2C1P98194 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ATP2C1P98194 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ATP2C1P98194 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ATP2C1P98194 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ATP2C1P98194 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
ATP2C1P98194 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ATP2C1P98194 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ATP2C1P98194 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ATP2C1P98194 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ATP2C1P98194 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ATP2C1P98194 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ATP2C1P98194 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ATP2C1P98194 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.4 ms