Protein–RNA interactions for Protein: P31270

HOXA11, Homeobox protein Hox-A11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 313 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA11P31270 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HOXA11P31270 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HOXA11P31270 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HOXA11P31270 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
HOXA11P31270 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
HOXA11P31270 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
HOXA11P31270 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HOXA11P31270 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HOXA11P31270 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HOXA11P31270 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HOXA11P31270 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HOXA11P31270 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
HOXA11P31270 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
HOXA11P31270 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HOXA11P31270 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
HOXA11P31270 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HOXA11P31270 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HOXA11P31270 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HOXA11P31270 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
HOXA11P31270 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
HOXA11P31270 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HOXA11P31270 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
HOXA11P31270 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HOXA11P31270 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HOXA11P31270 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
HOXA11P31270 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
HOXA11P31270 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HOXA11P31270 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
HOXA11P31270 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HOXA11P31270 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HOXA11P31270 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HOXA11P31270 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HOXA11P31270 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
HOXA11P31270 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HOXA11P31270 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HOXA11P31270 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
HOXA11P31270 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
HOXA11P31270 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
HOXA11P31270 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
HOXA11P31270 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
HOXA11P31270 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
HOXA11P31270 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
HOXA11P31270 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
HOXA11P31270 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
HOXA11P31270 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
HOXA11P31270 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
HOXA11P31270 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
HOXA11P31270 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
HOXA11P31270 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
HOXA11P31270 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
HOXA11P31270 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
HOXA11P31270 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
HOXA11P31270 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
HOXA11P31270 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
HOXA11P31270 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
HOXA11P31270 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
HOXA11P31270 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
HOXA11P31270 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
HOXA11P31270 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
HOXA11P31270 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
HOXA11P31270 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
HOXA11P31270 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
HOXA11P31270 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
HOXA11P31270 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
HOXA11P31270 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
HOXA11P31270 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
HOXA11P31270 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
HOXA11P31270 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
HOXA11P31270 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
HOXA11P31270 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
HOXA11P31270 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
HOXA11P31270 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
HOXA11P31270 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
HOXA11P31270 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
HOXA11P31270 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
HOXA11P31270 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
HOXA11P31270 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
HOXA11P31270 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
HOXA11P31270 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
HOXA11P31270 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
HOXA11P31270 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
HOXA11P31270 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
HOXA11P31270 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
HOXA11P31270 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
HOXA11P31270 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
HOXA11P31270 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
HOXA11P31270 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
HOXA11P31270 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
HOXA11P31270 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
HOXA11P31270 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
HOXA11P31270 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
HOXA11P31270 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
HOXA11P31270 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
HOXA11P31270 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
HOXA11P31270 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
HOXA11P31270 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
HOXA11P31270 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
HOXA11P31270 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
HOXA11P31270 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
HOXA11P31270 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69 ms