Protein–RNA interactions for Protein: P25788

PSMA3, Proteasome subunit alpha type-3, humanhuman

Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMA3P25788 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PSMA3P25788 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PSMA3P25788 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PSMA3P25788 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PSMA3P25788 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PSMA3P25788 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PSMA3P25788 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PSMA3P25788 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PSMA3P25788 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PSMA3P25788 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PSMA3P25788 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PSMA3P25788 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PSMA3P25788 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PSMA3P25788 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PSMA3P25788 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PSMA3P25788 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PSMA3P25788 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PSMA3P25788 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PSMA3P25788 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PSMA3P25788 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PSMA3P25788 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
PSMA3P25788 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PSMA3P25788 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
PSMA3P25788 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PSMA3P25788 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PSMA3P25788 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PSMA3P25788 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PSMA3P25788 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PSMA3P25788 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PSMA3P25788 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PSMA3P25788 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
PSMA3P25788 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC18.77■□□□□ 0.59
PSMA3P25788 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PSMA3P25788 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PSMA3P25788 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PSMA3P25788 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PSMA3P25788 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PSMA3P25788 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PSMA3P25788 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PSMA3P25788 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PSMA3P25788 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PSMA3P25788 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PSMA3P25788 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PSMA3P25788 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PSMA3P25788 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
PSMA3P25788 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PSMA3P25788 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
PSMA3P25788 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PSMA3P25788 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PSMA3P25788 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PSMA3P25788 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PSMA3P25788 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PSMA3P25788 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PSMA3P25788 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PSMA3P25788 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PSMA3P25788 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PSMA3P25788 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PSMA3P25788 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PSMA3P25788 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PSMA3P25788 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PSMA3P25788 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PSMA3P25788 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PSMA3P25788 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PSMA3P25788 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PSMA3P25788 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PSMA3P25788 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
PSMA3P25788 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PSMA3P25788 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PSMA3P25788 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
PSMA3P25788 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PSMA3P25788 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PSMA3P25788 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PSMA3P25788 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PSMA3P25788 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PSMA3P25788 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PSMA3P25788 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PSMA3P25788 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PSMA3P25788 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PSMA3P25788 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PSMA3P25788 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
PSMA3P25788 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PSMA3P25788 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PSMA3P25788 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PSMA3P25788 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PSMA3P25788 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PSMA3P25788 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PSMA3P25788 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PSMA3P25788 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PSMA3P25788 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PSMA3P25788 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PSMA3P25788 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PSMA3P25788 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PSMA3P25788 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PSMA3P25788 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PSMA3P25788 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PSMA3P25788 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PSMA3P25788 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PSMA3P25788 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PSMA3P25788 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PSMA3P25788 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms