Protein–RNA interactions for Protein: P20337

RAB3B, Ras-related protein Rab-3B, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB3BP20337 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RAB3BP20337 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RAB3BP20337 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RAB3BP20337 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RAB3BP20337 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RAB3BP20337 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RAB3BP20337 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RAB3BP20337 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RAB3BP20337 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RAB3BP20337 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RAB3BP20337 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RAB3BP20337 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RAB3BP20337 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RAB3BP20337 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RAB3BP20337 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RAB3BP20337 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RAB3BP20337 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RAB3BP20337 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RAB3BP20337 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RAB3BP20337 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RAB3BP20337 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RAB3BP20337 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RAB3BP20337 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RAB3BP20337 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RAB3BP20337 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RAB3BP20337 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RAB3BP20337 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RAB3BP20337 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RAB3BP20337 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RAB3BP20337 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RAB3BP20337 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RAB3BP20337 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RAB3BP20337 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RAB3BP20337 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RAB3BP20337 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RAB3BP20337 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RAB3BP20337 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RAB3BP20337 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
RAB3BP20337 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RAB3BP20337 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RAB3BP20337 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RAB3BP20337 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RAB3BP20337 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RAB3BP20337 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RAB3BP20337 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RAB3BP20337 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RAB3BP20337 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RAB3BP20337 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RAB3BP20337 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RAB3BP20337 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RAB3BP20337 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RAB3BP20337 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RAB3BP20337 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RAB3BP20337 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RAB3BP20337 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAB3BP20337 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAB3BP20337 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAB3BP20337 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAB3BP20337 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAB3BP20337 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAB3BP20337 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAB3BP20337 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAB3BP20337 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
RAB3BP20337 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAB3BP20337 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAB3BP20337 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAB3BP20337 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAB3BP20337 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAB3BP20337 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAB3BP20337 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAB3BP20337 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
RAB3BP20337 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAB3BP20337 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAB3BP20337 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
RAB3BP20337 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAB3BP20337 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAB3BP20337 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAB3BP20337 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAB3BP20337 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAB3BP20337 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAB3BP20337 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAB3BP20337 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAB3BP20337 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAB3BP20337 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAB3BP20337 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAB3BP20337 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAB3BP20337 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAB3BP20337 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAB3BP20337 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAB3BP20337 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAB3BP20337 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAB3BP20337 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAB3BP20337 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAB3BP20337 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAB3BP20337 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAB3BP20337 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAB3BP20337 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAB3BP20337 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAB3BP20337 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAB3BP20337 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms