Protein–RNA interactions for Protein: P0C879

Putative uncharacterized protein FLJ43185, humanhuman

Predictions only

Length 139 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P0C879 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
P0C879 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
P0C879 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
P0C879 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P0C879 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P0C879 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
P0C879 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P0C879 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
P0C879 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
P0C879 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P0C879 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
P0C879 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
P0C879 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P0C879 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P0C879 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P0C879 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P0C879 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P0C879 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P0C879 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P0C879 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
P0C879 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
P0C879 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
P0C879 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P0C879 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
P0C879 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
P0C879 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P0C879 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
P0C879 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P0C879 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P0C879 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
P0C879 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P0C879 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P0C879 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P0C879 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
P0C879 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
P0C879 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
P0C879 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
P0C879 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P0C879 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P0C879 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
P0C879 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
P0C879 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P0C879 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P0C879 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P0C879 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P0C879 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
P0C879 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
P0C879 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
P0C879 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P0C879 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
P0C879 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P0C879 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P0C879 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P0C879 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
P0C879 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
P0C879 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P0C879 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P0C879 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P0C879 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P0C879 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P0C879 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P0C879 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
P0C879 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
P0C879 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
P0C879 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
P0C879 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P0C879 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
P0C879 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
P0C879 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
P0C879 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
P0C879 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0.01
P0C879 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P0C879 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
P0C879 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
P0C879 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P0C879 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
P0C879 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P0C879 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P0C879 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P0C879 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P0C879 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
P0C879 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC15.08■□□□□ 0
P0C879 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P0C879 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P0C879 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
P0C879 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P0C879 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P0C879 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P0C879 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P0C879 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P0C879 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
P0C879 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P0C879 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P0C879 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
P0C879 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
P0C879 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P0C879 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
P0C879 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P0C879 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
P0C879 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms