Protein–RNA interactions for Protein: P09110

ACAA1, 3-ketoacyl-CoA thiolase, peroxisomal, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACAA1P09110 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACAA1P09110 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACAA1P09110 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACAA1P09110 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACAA1P09110 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACAA1P09110 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACAA1P09110 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
ACAA1P09110 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ACAA1P09110 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ACAA1P09110 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ACAA1P09110 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ACAA1P09110 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ACAA1P09110 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ACAA1P09110 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ACAA1P09110 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
ACAA1P09110 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ACAA1P09110 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ACAA1P09110 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ACAA1P09110 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ACAA1P09110 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ACAA1P09110 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ACAA1P09110 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ACAA1P09110 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ACAA1P09110 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ACAA1P09110 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ACAA1P09110 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ACAA1P09110 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ACAA1P09110 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ACAA1P09110 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ACAA1P09110 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ACAA1P09110 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ACAA1P09110 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ACAA1P09110 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ACAA1P09110 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ACAA1P09110 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ACAA1P09110 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ACAA1P09110 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ACAA1P09110 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ACAA1P09110 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ACAA1P09110 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ACAA1P09110 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ACAA1P09110 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ACAA1P09110 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ACAA1P09110 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ACAA1P09110 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ACAA1P09110 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ACAA1P09110 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ACAA1P09110 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
ACAA1P09110 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ACAA1P09110 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
ACAA1P09110 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ACAA1P09110 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
ACAA1P09110 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
ACAA1P09110 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ACAA1P09110 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ACAA1P09110 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
ACAA1P09110 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ACAA1P09110 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
ACAA1P09110 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
ACAA1P09110 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ACAA1P09110 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ACAA1P09110 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ACAA1P09110 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ACAA1P09110 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ACAA1P09110 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ACAA1P09110 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ACAA1P09110 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ACAA1P09110 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ACAA1P09110 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ACAA1P09110 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ACAA1P09110 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ACAA1P09110 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ACAA1P09110 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ACAA1P09110 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ACAA1P09110 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
ACAA1P09110 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ACAA1P09110 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
ACAA1P09110 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ACAA1P09110 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ACAA1P09110 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ACAA1P09110 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ACAA1P09110 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ACAA1P09110 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
ACAA1P09110 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ACAA1P09110 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ACAA1P09110 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ACAA1P09110 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ACAA1P09110 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ACAA1P09110 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ACAA1P09110 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ACAA1P09110 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ACAA1P09110 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
ACAA1P09110 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ACAA1P09110 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ACAA1P09110 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ACAA1P09110 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ACAA1P09110 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ACAA1P09110 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ACAA1P09110 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ACAA1P09110 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms