Protein–RNA interactions for Protein: O75400

PRPF40A, Pre-mRNA-processing factor 40 homolog A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 957 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF40AO75400 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
PRPF40AO75400 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
PRPF40AO75400 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
PRPF40AO75400 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.1
PRPF40AO75400 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
PRPF40AO75400 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
PRPF40AO75400 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
PRPF40AO75400 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
PRPF40AO75400 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PRPF40AO75400 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PRPF40AO75400 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PRPF40AO75400 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PRPF40AO75400 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PRPF40AO75400 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PRPF40AO75400 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PRPF40AO75400 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
PRPF40AO75400 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PRPF40AO75400 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PRPF40AO75400 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PRPF40AO75400 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PRPF40AO75400 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PRPF40AO75400 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
PRPF40AO75400 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PRPF40AO75400 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PRPF40AO75400 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PRPF40AO75400 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PRPF40AO75400 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PRPF40AO75400 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PRPF40AO75400 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PRPF40AO75400 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PRPF40AO75400 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PRPF40AO75400 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PRPF40AO75400 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PRPF40AO75400 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PRPF40AO75400 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PRPF40AO75400 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PRPF40AO75400 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PRPF40AO75400 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PRPF40AO75400 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PRPF40AO75400 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PRPF40AO75400 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PRPF40AO75400 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PRPF40AO75400 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PRPF40AO75400 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PRPF40AO75400 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PRPF40AO75400 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PRPF40AO75400 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PRPF40AO75400 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PRPF40AO75400 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PRPF40AO75400 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PRPF40AO75400 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PRPF40AO75400 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PRPF40AO75400 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PRPF40AO75400 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PRPF40AO75400 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PRPF40AO75400 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PRPF40AO75400 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PRPF40AO75400 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PRPF40AO75400 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PRPF40AO75400 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PRPF40AO75400 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PRPF40AO75400 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PRPF40AO75400 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PRPF40AO75400 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PRPF40AO75400 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PRPF40AO75400 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PRPF40AO75400 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PRPF40AO75400 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PRPF40AO75400 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PRPF40AO75400 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PRPF40AO75400 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PRPF40AO75400 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PRPF40AO75400 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PRPF40AO75400 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PRPF40AO75400 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PRPF40AO75400 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PRPF40AO75400 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PRPF40AO75400 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PRPF40AO75400 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PRPF40AO75400 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PRPF40AO75400 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PRPF40AO75400 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PRPF40AO75400 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PRPF40AO75400 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PRPF40AO75400 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PRPF40AO75400 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PRPF40AO75400 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PRPF40AO75400 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PRPF40AO75400 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PRPF40AO75400 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PRPF40AO75400 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PRPF40AO75400 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PRPF40AO75400 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PRPF40AO75400 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PRPF40AO75400 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PRPF40AO75400 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PRPF40AO75400 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PRPF40AO75400 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PRPF40AO75400 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PRPF40AO75400 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
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