Protein–RNA interactions for Protein: O43760

SYNGR2, Synaptogyrin-2, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNGR2O43760 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SYNGR2O43760 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SYNGR2O43760 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SYNGR2O43760 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SYNGR2O43760 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SYNGR2O43760 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SYNGR2O43760 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SYNGR2O43760 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SYNGR2O43760 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SYNGR2O43760 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SYNGR2O43760 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SYNGR2O43760 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SYNGR2O43760 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SYNGR2O43760 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SYNGR2O43760 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SYNGR2O43760 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
SYNGR2O43760 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
SYNGR2O43760 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SYNGR2O43760 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SYNGR2O43760 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
SYNGR2O43760 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SYNGR2O43760 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SYNGR2O43760 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SYNGR2O43760 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SYNGR2O43760 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SYNGR2O43760 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SYNGR2O43760 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SYNGR2O43760 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SYNGR2O43760 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SYNGR2O43760 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SYNGR2O43760 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SYNGR2O43760 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SYNGR2O43760 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SYNGR2O43760 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
SYNGR2O43760 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SYNGR2O43760 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SYNGR2O43760 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SYNGR2O43760 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SYNGR2O43760 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SYNGR2O43760 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SYNGR2O43760 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SYNGR2O43760 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SYNGR2O43760 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SYNGR2O43760 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SYNGR2O43760 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SYNGR2O43760 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SYNGR2O43760 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SYNGR2O43760 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SYNGR2O43760 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SYNGR2O43760 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SYNGR2O43760 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SYNGR2O43760 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SYNGR2O43760 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SYNGR2O43760 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SYNGR2O43760 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SYNGR2O43760 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SYNGR2O43760 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SYNGR2O43760 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SYNGR2O43760 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SYNGR2O43760 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SYNGR2O43760 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SYNGR2O43760 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SYNGR2O43760 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SYNGR2O43760 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SYNGR2O43760 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SYNGR2O43760 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SYNGR2O43760 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SYNGR2O43760 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SYNGR2O43760 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SYNGR2O43760 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SYNGR2O43760 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SYNGR2O43760 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SYNGR2O43760 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SYNGR2O43760 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SYNGR2O43760 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SYNGR2O43760 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SYNGR2O43760 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SYNGR2O43760 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SYNGR2O43760 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SYNGR2O43760 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SYNGR2O43760 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SYNGR2O43760 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
SYNGR2O43760 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SYNGR2O43760 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SYNGR2O43760 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SYNGR2O43760 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SYNGR2O43760 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SYNGR2O43760 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SYNGR2O43760 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SYNGR2O43760 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SYNGR2O43760 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SYNGR2O43760 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SYNGR2O43760 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SYNGR2O43760 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SYNGR2O43760 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SYNGR2O43760 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SYNGR2O43760 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SYNGR2O43760 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SYNGR2O43760 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SYNGR2O43760 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms