Protein–RNA interactions for Protein: A6NEF3

GOLGA6L4, Golgin subfamily A member 6-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA6L4A6NEF3 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
GOLGA6L4A6NEF3 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
GOLGA6L4A6NEF3 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
GOLGA6L4A6NEF3 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
GOLGA6L4A6NEF3 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GOLGA6L4A6NEF3 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
GOLGA6L4A6NEF3 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GOLGA6L4A6NEF3 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GOLGA6L4A6NEF3 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
GOLGA6L4A6NEF3 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
GOLGA6L4A6NEF3 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
GOLGA6L4A6NEF3 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GOLGA6L4A6NEF3 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GOLGA6L4A6NEF3 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GOLGA6L4A6NEF3 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GOLGA6L4A6NEF3 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
GOLGA6L4A6NEF3 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GOLGA6L4A6NEF3 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
GOLGA6L4A6NEF3 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
GOLGA6L4A6NEF3 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GOLGA6L4A6NEF3 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
GOLGA6L4A6NEF3 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
GOLGA6L4A6NEF3 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GOLGA6L4A6NEF3 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GOLGA6L4A6NEF3 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GOLGA6L4A6NEF3 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
GOLGA6L4A6NEF3 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GOLGA6L4A6NEF3 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
GOLGA6L4A6NEF3 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
GOLGA6L4A6NEF3 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
GOLGA6L4A6NEF3 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GOLGA6L4A6NEF3 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GOLGA6L4A6NEF3 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
GOLGA6L4A6NEF3 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GOLGA6L4A6NEF3 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
GOLGA6L4A6NEF3 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
GOLGA6L4A6NEF3 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GOLGA6L4A6NEF3 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
GOLGA6L4A6NEF3 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GOLGA6L4A6NEF3 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
GOLGA6L4A6NEF3 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
GOLGA6L4A6NEF3 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
GOLGA6L4A6NEF3 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
GOLGA6L4A6NEF3 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GOLGA6L4A6NEF3 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
GOLGA6L4A6NEF3 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GOLGA6L4A6NEF3 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
GOLGA6L4A6NEF3 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GOLGA6L4A6NEF3 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GOLGA6L4A6NEF3 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
GOLGA6L4A6NEF3 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GOLGA6L4A6NEF3 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GOLGA6L4A6NEF3 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GOLGA6L4A6NEF3 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GOLGA6L4A6NEF3 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
GOLGA6L4A6NEF3 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GOLGA6L4A6NEF3 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
GOLGA6L4A6NEF3 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
GOLGA6L4A6NEF3 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
GOLGA6L4A6NEF3 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
GOLGA6L4A6NEF3 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
GOLGA6L4A6NEF3 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GOLGA6L4A6NEF3 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GOLGA6L4A6NEF3 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GOLGA6L4A6NEF3 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
GOLGA6L4A6NEF3 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
GOLGA6L4A6NEF3 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
GOLGA6L4A6NEF3 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GOLGA6L4A6NEF3 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GOLGA6L4A6NEF3 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GOLGA6L4A6NEF3 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
GOLGA6L4A6NEF3 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GOLGA6L4A6NEF3 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GOLGA6L4A6NEF3 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GOLGA6L4A6NEF3 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GOLGA6L4A6NEF3 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GOLGA6L4A6NEF3 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
GOLGA6L4A6NEF3 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GOLGA6L4A6NEF3 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GOLGA6L4A6NEF3 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
GOLGA6L4A6NEF3 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
GOLGA6L4A6NEF3 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
GOLGA6L4A6NEF3 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
GOLGA6L4A6NEF3 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GOLGA6L4A6NEF3 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GOLGA6L4A6NEF3 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GOLGA6L4A6NEF3 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GOLGA6L4A6NEF3 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GOLGA6L4A6NEF3 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GOLGA6L4A6NEF3 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GOLGA6L4A6NEF3 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GOLGA6L4A6NEF3 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GOLGA6L4A6NEF3 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
GOLGA6L4A6NEF3 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GOLGA6L4A6NEF3 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GOLGA6L4A6NEF3 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GOLGA6L4A6NEF3 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GOLGA6L4A6NEF3 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GOLGA6L4A6NEF3 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GOLGA6L4A6NEF3 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms