Protein–RNA interactions for Protein: A6NE82

MBD3L3, Putative methyl-CpG-binding domain protein 3-like 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MBD3L3A6NE82 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
MBD3L3A6NE82 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
MBD3L3A6NE82 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
MBD3L3A6NE82 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
MBD3L3A6NE82 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
MBD3L3A6NE82 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
MBD3L3A6NE82 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
MBD3L3A6NE82 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
MBD3L3A6NE82 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MBD3L3A6NE82 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MBD3L3A6NE82 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MBD3L3A6NE82 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MBD3L3A6NE82 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
MBD3L3A6NE82 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
MBD3L3A6NE82 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
MBD3L3A6NE82 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
MBD3L3A6NE82 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
MBD3L3A6NE82 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MBD3L3A6NE82 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MBD3L3A6NE82 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
MBD3L3A6NE82 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
MBD3L3A6NE82 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
MBD3L3A6NE82 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
MBD3L3A6NE82 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
MBD3L3A6NE82 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MBD3L3A6NE82 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
MBD3L3A6NE82 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MBD3L3A6NE82 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
MBD3L3A6NE82 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
MBD3L3A6NE82 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
MBD3L3A6NE82 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MBD3L3A6NE82 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
MBD3L3A6NE82 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
MBD3L3A6NE82 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MBD3L3A6NE82 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
MBD3L3A6NE82 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MBD3L3A6NE82 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MBD3L3A6NE82 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MBD3L3A6NE82 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MBD3L3A6NE82 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MBD3L3A6NE82 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MBD3L3A6NE82 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
MBD3L3A6NE82 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MBD3L3A6NE82 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
MBD3L3A6NE82 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
MBD3L3A6NE82 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
MBD3L3A6NE82 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
MBD3L3A6NE82 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
MBD3L3A6NE82 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MBD3L3A6NE82 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
MBD3L3A6NE82 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MBD3L3A6NE82 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
MBD3L3A6NE82 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MBD3L3A6NE82 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MBD3L3A6NE82 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
MBD3L3A6NE82 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
MBD3L3A6NE82 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MBD3L3A6NE82 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
MBD3L3A6NE82 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
MBD3L3A6NE82 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
MBD3L3A6NE82 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
MBD3L3A6NE82 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
MBD3L3A6NE82 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
MBD3L3A6NE82 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
MBD3L3A6NE82 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
MBD3L3A6NE82 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
MBD3L3A6NE82 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
MBD3L3A6NE82 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
MBD3L3A6NE82 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
MBD3L3A6NE82 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
MBD3L3A6NE82 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
MBD3L3A6NE82 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
MBD3L3A6NE82 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
MBD3L3A6NE82 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
MBD3L3A6NE82 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
MBD3L3A6NE82 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
MBD3L3A6NE82 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
MBD3L3A6NE82 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
MBD3L3A6NE82 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
MBD3L3A6NE82 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
MBD3L3A6NE82 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
MBD3L3A6NE82 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
MBD3L3A6NE82 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
MBD3L3A6NE82 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
MBD3L3A6NE82 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
MBD3L3A6NE82 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
MBD3L3A6NE82 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
MBD3L3A6NE82 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
MBD3L3A6NE82 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
MBD3L3A6NE82 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
MBD3L3A6NE82 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MBD3L3A6NE82 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
MBD3L3A6NE82 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MBD3L3A6NE82 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MBD3L3A6NE82 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MBD3L3A6NE82 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MBD3L3A6NE82 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MBD3L3A6NE82 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MBD3L3A6NE82 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MBD3L3A6NE82 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms