Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6Q1

CAPN6, Calpain-6, humanhuman

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Length 641 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN6Q9Y6Q1 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CAPN6Q9Y6Q1 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CAPN6Q9Y6Q1 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CAPN6Q9Y6Q1 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CAPN6Q9Y6Q1 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CAPN6Q9Y6Q1 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CAPN6Q9Y6Q1 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CAPN6Q9Y6Q1 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CAPN6Q9Y6Q1 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CAPN6Q9Y6Q1 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CAPN6Q9Y6Q1 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CAPN6Q9Y6Q1 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CAPN6Q9Y6Q1 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CAPN6Q9Y6Q1 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CAPN6Q9Y6Q1 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CAPN6Q9Y6Q1 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CAPN6Q9Y6Q1 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CAPN6Q9Y6Q1 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CAPN6Q9Y6Q1 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CAPN6Q9Y6Q1 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CAPN6Q9Y6Q1 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
CAPN6Q9Y6Q1 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CAPN6Q9Y6Q1 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CAPN6Q9Y6Q1 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CAPN6Q9Y6Q1 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CAPN6Q9Y6Q1 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CAPN6Q9Y6Q1 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CAPN6Q9Y6Q1 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CAPN6Q9Y6Q1 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CAPN6Q9Y6Q1 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CAPN6Q9Y6Q1 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CAPN6Q9Y6Q1 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CAPN6Q9Y6Q1 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CAPN6Q9Y6Q1 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CAPN6Q9Y6Q1 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CAPN6Q9Y6Q1 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CAPN6Q9Y6Q1 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CAPN6Q9Y6Q1 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CAPN6Q9Y6Q1 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CAPN6Q9Y6Q1 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CAPN6Q9Y6Q1 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CAPN6Q9Y6Q1 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CAPN6Q9Y6Q1 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CAPN6Q9Y6Q1 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CAPN6Q9Y6Q1 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
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CAPN6Q9Y6Q1 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
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CAPN6Q9Y6Q1 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CAPN6Q9Y6Q1 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
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CAPN6Q9Y6Q1 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
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CAPN6Q9Y6Q1 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CAPN6Q9Y6Q1 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CAPN6Q9Y6Q1 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
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CAPN6Q9Y6Q1 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CAPN6Q9Y6Q1 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CAPN6Q9Y6Q1 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CAPN6Q9Y6Q1 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CAPN6Q9Y6Q1 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CAPN6Q9Y6Q1 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CAPN6Q9Y6Q1 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CAPN6Q9Y6Q1 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CAPN6Q9Y6Q1 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
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CAPN6Q9Y6Q1 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
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CAPN6Q9Y6Q1 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CAPN6Q9Y6Q1 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CAPN6Q9Y6Q1 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CAPN6Q9Y6Q1 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
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CAPN6Q9Y6Q1 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CAPN6Q9Y6Q1 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CAPN6Q9Y6Q1 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CAPN6Q9Y6Q1 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CAPN6Q9Y6Q1 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CAPN6Q9Y6Q1 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CAPN6Q9Y6Q1 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CAPN6Q9Y6Q1 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CAPN6Q9Y6Q1 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CAPN6Q9Y6Q1 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CAPN6Q9Y6Q1 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CAPN6Q9Y6Q1 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CAPN6Q9Y6Q1 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CAPN6Q9Y6Q1 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
CAPN6Q9Y6Q1 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CAPN6Q9Y6Q1 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CAPN6Q9Y6Q1 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CAPN6Q9Y6Q1 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CAPN6Q9Y6Q1 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CAPN6Q9Y6Q1 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CAPN6Q9Y6Q1 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CAPN6Q9Y6Q1 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CAPN6Q9Y6Q1 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CAPN6Q9Y6Q1 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CAPN6Q9Y6Q1 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
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