Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y664

KPTN, KICSTOR complex protein kaptin, humanhuman

Predictions only

Length 436 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KPTNQ9Y664 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KPTNQ9Y664 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KPTNQ9Y664 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KPTNQ9Y664 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KPTNQ9Y664 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KPTNQ9Y664 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KPTNQ9Y664 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KPTNQ9Y664 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
KPTNQ9Y664 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KPTNQ9Y664 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KPTNQ9Y664 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KPTNQ9Y664 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KPTNQ9Y664 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KPTNQ9Y664 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KPTNQ9Y664 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KPTNQ9Y664 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KPTNQ9Y664 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KPTNQ9Y664 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KPTNQ9Y664 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KPTNQ9Y664 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KPTNQ9Y664 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KPTNQ9Y664 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KPTNQ9Y664 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KPTNQ9Y664 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KPTNQ9Y664 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KPTNQ9Y664 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KPTNQ9Y664 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KPTNQ9Y664 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KPTNQ9Y664 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KPTNQ9Y664 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KPTNQ9Y664 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KPTNQ9Y664 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KPTNQ9Y664 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KPTNQ9Y664 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KPTNQ9Y664 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KPTNQ9Y664 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KPTNQ9Y664 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KPTNQ9Y664 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KPTNQ9Y664 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KPTNQ9Y664 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KPTNQ9Y664 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
KPTNQ9Y664 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KPTNQ9Y664 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KPTNQ9Y664 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KPTNQ9Y664 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KPTNQ9Y664 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KPTNQ9Y664 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KPTNQ9Y664 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KPTNQ9Y664 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KPTNQ9Y664 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KPTNQ9Y664 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KPTNQ9Y664 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KPTNQ9Y664 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KPTNQ9Y664 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KPTNQ9Y664 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KPTNQ9Y664 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KPTNQ9Y664 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KPTNQ9Y664 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KPTNQ9Y664 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KPTNQ9Y664 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KPTNQ9Y664 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KPTNQ9Y664 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KPTNQ9Y664 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KPTNQ9Y664 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KPTNQ9Y664 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
KPTNQ9Y664 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KPTNQ9Y664 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KPTNQ9Y664 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KPTNQ9Y664 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
KPTNQ9Y664 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
KPTNQ9Y664 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
KPTNQ9Y664 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
KPTNQ9Y664 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
KPTNQ9Y664 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
KPTNQ9Y664 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
KPTNQ9Y664 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
KPTNQ9Y664 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
KPTNQ9Y664 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
KPTNQ9Y664 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
KPTNQ9Y664 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
KPTNQ9Y664 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
KPTNQ9Y664 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
KPTNQ9Y664 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
KPTNQ9Y664 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
KPTNQ9Y664 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
KPTNQ9Y664 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
KPTNQ9Y664 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
KPTNQ9Y664 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
KPTNQ9Y664 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
KPTNQ9Y664 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
KPTNQ9Y664 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
KPTNQ9Y664 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
KPTNQ9Y664 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
KPTNQ9Y664 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
KPTNQ9Y664 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
KPTNQ9Y664 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
KPTNQ9Y664 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
KPTNQ9Y664 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
KPTNQ9Y664 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
KPTNQ9Y664 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms