Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2K6

KLHL42, Kelch-like protein 42, humanhuman

Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL42Q9P2K6 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
KLHL42Q9P2K6 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
KLHL42Q9P2K6 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
KLHL42Q9P2K6 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
KLHL42Q9P2K6 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
KLHL42Q9P2K6 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
KLHL42Q9P2K6 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
KLHL42Q9P2K6 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
KLHL42Q9P2K6 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
KLHL42Q9P2K6 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
KLHL42Q9P2K6 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
KLHL42Q9P2K6 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
KLHL42Q9P2K6 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
KLHL42Q9P2K6 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
KLHL42Q9P2K6 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
KLHL42Q9P2K6 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
KLHL42Q9P2K6 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
KLHL42Q9P2K6 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
KLHL42Q9P2K6 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
KLHL42Q9P2K6 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
KLHL42Q9P2K6 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
KLHL42Q9P2K6 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
KLHL42Q9P2K6 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
KLHL42Q9P2K6 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
KLHL42Q9P2K6 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
KLHL42Q9P2K6 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
KLHL42Q9P2K6 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
KLHL42Q9P2K6 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
KLHL42Q9P2K6 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
KLHL42Q9P2K6 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
KLHL42Q9P2K6 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
KLHL42Q9P2K6 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
KLHL42Q9P2K6 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
KLHL42Q9P2K6 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
KLHL42Q9P2K6 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
KLHL42Q9P2K6 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
KLHL42Q9P2K6 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
KLHL42Q9P2K6 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
KLHL42Q9P2K6 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
KLHL42Q9P2K6 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
KLHL42Q9P2K6 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
KLHL42Q9P2K6 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
KLHL42Q9P2K6 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
KLHL42Q9P2K6 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
KLHL42Q9P2K6 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
KLHL42Q9P2K6 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
KLHL42Q9P2K6 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
KLHL42Q9P2K6 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC18.4■□□□□ 0.54
KLHL42Q9P2K6 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
KLHL42Q9P2K6 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
KLHL42Q9P2K6 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
KLHL42Q9P2K6 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
KLHL42Q9P2K6 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
KLHL42Q9P2K6 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
KLHL42Q9P2K6 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
KLHL42Q9P2K6 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
KLHL42Q9P2K6 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
KLHL42Q9P2K6 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
KLHL42Q9P2K6 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
KLHL42Q9P2K6 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
KLHL42Q9P2K6 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
KLHL42Q9P2K6 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
KLHL42Q9P2K6 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
KLHL42Q9P2K6 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
KLHL42Q9P2K6 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
KLHL42Q9P2K6 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
KLHL42Q9P2K6 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
KLHL42Q9P2K6 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
KLHL42Q9P2K6 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
KLHL42Q9P2K6 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
KLHL42Q9P2K6 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
KLHL42Q9P2K6 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
KLHL42Q9P2K6 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
KLHL42Q9P2K6 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
KLHL42Q9P2K6 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
KLHL42Q9P2K6 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
KLHL42Q9P2K6 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
KLHL42Q9P2K6 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
KLHL42Q9P2K6 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
KLHL42Q9P2K6 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
KLHL42Q9P2K6 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
KLHL42Q9P2K6 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
KLHL42Q9P2K6 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
KLHL42Q9P2K6 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
KLHL42Q9P2K6 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
KLHL42Q9P2K6 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
KLHL42Q9P2K6 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
KLHL42Q9P2K6 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
KLHL42Q9P2K6 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
KLHL42Q9P2K6 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
KLHL42Q9P2K6 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
KLHL42Q9P2K6 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
KLHL42Q9P2K6 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
KLHL42Q9P2K6 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
KLHL42Q9P2K6 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
KLHL42Q9P2K6 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
KLHL42Q9P2K6 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
KLHL42Q9P2K6 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
KLHL42Q9P2K6 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
KLHL42Q9P2K6 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms