Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZN4

EHD2, EH domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 543 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EHD2Q9NZN4 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
EHD2Q9NZN4 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
EHD2Q9NZN4 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
EHD2Q9NZN4 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
EHD2Q9NZN4 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
EHD2Q9NZN4 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
EHD2Q9NZN4 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
EHD2Q9NZN4 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
EHD2Q9NZN4 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
EHD2Q9NZN4 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
EHD2Q9NZN4 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
EHD2Q9NZN4 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
EHD2Q9NZN4 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
EHD2Q9NZN4 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
EHD2Q9NZN4 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
EHD2Q9NZN4 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
EHD2Q9NZN4 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
EHD2Q9NZN4 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
EHD2Q9NZN4 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
EHD2Q9NZN4 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
EHD2Q9NZN4 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
EHD2Q9NZN4 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
EHD2Q9NZN4 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
EHD2Q9NZN4 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
EHD2Q9NZN4 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
EHD2Q9NZN4 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
EHD2Q9NZN4 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
EHD2Q9NZN4 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
EHD2Q9NZN4 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
EHD2Q9NZN4 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
EHD2Q9NZN4 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
EHD2Q9NZN4 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
EHD2Q9NZN4 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
EHD2Q9NZN4 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
EHD2Q9NZN4 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
EHD2Q9NZN4 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
EHD2Q9NZN4 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
EHD2Q9NZN4 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
EHD2Q9NZN4 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
EHD2Q9NZN4 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
EHD2Q9NZN4 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
EHD2Q9NZN4 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
EHD2Q9NZN4 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
EHD2Q9NZN4 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
EHD2Q9NZN4 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
EHD2Q9NZN4 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
EHD2Q9NZN4 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
EHD2Q9NZN4 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
EHD2Q9NZN4 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
EHD2Q9NZN4 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
EHD2Q9NZN4 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
EHD2Q9NZN4 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
EHD2Q9NZN4 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
EHD2Q9NZN4 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
EHD2Q9NZN4 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
EHD2Q9NZN4 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
EHD2Q9NZN4 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
EHD2Q9NZN4 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
EHD2Q9NZN4 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
EHD2Q9NZN4 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
EHD2Q9NZN4 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
EHD2Q9NZN4 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
EHD2Q9NZN4 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
EHD2Q9NZN4 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC20.41■□□□□ 0.86
EHD2Q9NZN4 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
EHD2Q9NZN4 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
EHD2Q9NZN4 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
EHD2Q9NZN4 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
EHD2Q9NZN4 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
EHD2Q9NZN4 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
EHD2Q9NZN4 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
EHD2Q9NZN4 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
EHD2Q9NZN4 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
EHD2Q9NZN4 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
EHD2Q9NZN4 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
EHD2Q9NZN4 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
EHD2Q9NZN4 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
EHD2Q9NZN4 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
EHD2Q9NZN4 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
EHD2Q9NZN4 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
EHD2Q9NZN4 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
EHD2Q9NZN4 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
EHD2Q9NZN4 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
EHD2Q9NZN4 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
EHD2Q9NZN4 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
EHD2Q9NZN4 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
EHD2Q9NZN4 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
EHD2Q9NZN4 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
EHD2Q9NZN4 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
EHD2Q9NZN4 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
EHD2Q9NZN4 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
EHD2Q9NZN4 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
EHD2Q9NZN4 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
EHD2Q9NZN4 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
EHD2Q9NZN4 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC20.4■□□□□ 0.86
EHD2Q9NZN4 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
EHD2Q9NZN4 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
EHD2Q9NZN4 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
EHD2Q9NZN4 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
EHD2Q9NZN4 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms