Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSN8

SNTG1, Gamma-1-syntrophin, humanhuman

Predictions only

Length 517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNTG1Q9NSN8 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SNTG1Q9NSN8 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SNTG1Q9NSN8 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SNTG1Q9NSN8 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SNTG1Q9NSN8 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SNTG1Q9NSN8 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SNTG1Q9NSN8 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SNTG1Q9NSN8 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SNTG1Q9NSN8 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SNTG1Q9NSN8 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SNTG1Q9NSN8 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SNTG1Q9NSN8 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SNTG1Q9NSN8 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SNTG1Q9NSN8 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SNTG1Q9NSN8 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SNTG1Q9NSN8 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SNTG1Q9NSN8 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SNTG1Q9NSN8 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SNTG1Q9NSN8 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SNTG1Q9NSN8 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SNTG1Q9NSN8 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
SNTG1Q9NSN8 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SNTG1Q9NSN8 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SNTG1Q9NSN8 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SNTG1Q9NSN8 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SNTG1Q9NSN8 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SNTG1Q9NSN8 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SNTG1Q9NSN8 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SNTG1Q9NSN8 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SNTG1Q9NSN8 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SNTG1Q9NSN8 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SNTG1Q9NSN8 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SNTG1Q9NSN8 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SNTG1Q9NSN8 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SNTG1Q9NSN8 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SNTG1Q9NSN8 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SNTG1Q9NSN8 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SNTG1Q9NSN8 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SNTG1Q9NSN8 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SNTG1Q9NSN8 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SNTG1Q9NSN8 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SNTG1Q9NSN8 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SNTG1Q9NSN8 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SNTG1Q9NSN8 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SNTG1Q9NSN8 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SNTG1Q9NSN8 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SNTG1Q9NSN8 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SNTG1Q9NSN8 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SNTG1Q9NSN8 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
SNTG1Q9NSN8 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SNTG1Q9NSN8 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
SNTG1Q9NSN8 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SNTG1Q9NSN8 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
SNTG1Q9NSN8 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SNTG1Q9NSN8 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
SNTG1Q9NSN8 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SNTG1Q9NSN8 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SNTG1Q9NSN8 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SNTG1Q9NSN8 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SNTG1Q9NSN8 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SNTG1Q9NSN8 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SNTG1Q9NSN8 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SNTG1Q9NSN8 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SNTG1Q9NSN8 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SNTG1Q9NSN8 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SNTG1Q9NSN8 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SNTG1Q9NSN8 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SNTG1Q9NSN8 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SNTG1Q9NSN8 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SNTG1Q9NSN8 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SNTG1Q9NSN8 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SNTG1Q9NSN8 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SNTG1Q9NSN8 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SNTG1Q9NSN8 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SNTG1Q9NSN8 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SNTG1Q9NSN8 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SNTG1Q9NSN8 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SNTG1Q9NSN8 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SNTG1Q9NSN8 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SNTG1Q9NSN8 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SNTG1Q9NSN8 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SNTG1Q9NSN8 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SNTG1Q9NSN8 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SNTG1Q9NSN8 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SNTG1Q9NSN8 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SNTG1Q9NSN8 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SNTG1Q9NSN8 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SNTG1Q9NSN8 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SNTG1Q9NSN8 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SNTG1Q9NSN8 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SNTG1Q9NSN8 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
SNTG1Q9NSN8 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SNTG1Q9NSN8 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SNTG1Q9NSN8 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SNTG1Q9NSN8 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SNTG1Q9NSN8 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SNTG1Q9NSN8 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SNTG1Q9NSN8 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SNTG1Q9NSN8 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
SNTG1Q9NSN8 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.2 ms