Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXT4

TDRD1, Tudor domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDRD1Q9BXT4 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TDRD1Q9BXT4 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TDRD1Q9BXT4 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TDRD1Q9BXT4 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TDRD1Q9BXT4 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TDRD1Q9BXT4 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TDRD1Q9BXT4 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TDRD1Q9BXT4 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
TDRD1Q9BXT4 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TDRD1Q9BXT4 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TDRD1Q9BXT4 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TDRD1Q9BXT4 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TDRD1Q9BXT4 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TDRD1Q9BXT4 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
TDRD1Q9BXT4 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TDRD1Q9BXT4 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TDRD1Q9BXT4 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TDRD1Q9BXT4 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TDRD1Q9BXT4 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TDRD1Q9BXT4 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TDRD1Q9BXT4 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TDRD1Q9BXT4 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TDRD1Q9BXT4 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TDRD1Q9BXT4 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
TDRD1Q9BXT4 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TDRD1Q9BXT4 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TDRD1Q9BXT4 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TDRD1Q9BXT4 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TDRD1Q9BXT4 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TDRD1Q9BXT4 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TDRD1Q9BXT4 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TDRD1Q9BXT4 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TDRD1Q9BXT4 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TDRD1Q9BXT4 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TDRD1Q9BXT4 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TDRD1Q9BXT4 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TDRD1Q9BXT4 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TDRD1Q9BXT4 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TDRD1Q9BXT4 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TDRD1Q9BXT4 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
TDRD1Q9BXT4 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TDRD1Q9BXT4 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TDRD1Q9BXT4 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TDRD1Q9BXT4 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
TDRD1Q9BXT4 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
TDRD1Q9BXT4 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TDRD1Q9BXT4 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TDRD1Q9BXT4 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TDRD1Q9BXT4 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TDRD1Q9BXT4 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TDRD1Q9BXT4 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TDRD1Q9BXT4 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TDRD1Q9BXT4 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TDRD1Q9BXT4 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TDRD1Q9BXT4 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TDRD1Q9BXT4 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TDRD1Q9BXT4 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TDRD1Q9BXT4 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TDRD1Q9BXT4 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TDRD1Q9BXT4 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TDRD1Q9BXT4 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TDRD1Q9BXT4 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TDRD1Q9BXT4 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TDRD1Q9BXT4 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TDRD1Q9BXT4 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TDRD1Q9BXT4 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TDRD1Q9BXT4 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TDRD1Q9BXT4 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
TDRD1Q9BXT4 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TDRD1Q9BXT4 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TDRD1Q9BXT4 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
TDRD1Q9BXT4 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
TDRD1Q9BXT4 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TDRD1Q9BXT4 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TDRD1Q9BXT4 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TDRD1Q9BXT4 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TDRD1Q9BXT4 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TDRD1Q9BXT4 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TDRD1Q9BXT4 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TDRD1Q9BXT4 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TDRD1Q9BXT4 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TDRD1Q9BXT4 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TDRD1Q9BXT4 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TDRD1Q9BXT4 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TDRD1Q9BXT4 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TDRD1Q9BXT4 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TDRD1Q9BXT4 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TDRD1Q9BXT4 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TDRD1Q9BXT4 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TDRD1Q9BXT4 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TDRD1Q9BXT4 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
TDRD1Q9BXT4 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TDRD1Q9BXT4 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TDRD1Q9BXT4 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TDRD1Q9BXT4 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TDRD1Q9BXT4 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TDRD1Q9BXT4 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TDRD1Q9BXT4 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TDRD1Q9BXT4 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TDRD1Q9BXT4 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC19.02■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms