Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ08

RETNLB, Resistin-like beta, humanhuman

Predictions only

Length 111 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RETNLBQ9BQ08 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
RETNLBQ9BQ08 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
RETNLBQ9BQ08 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
RETNLBQ9BQ08 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
RETNLBQ9BQ08 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
RETNLBQ9BQ08 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
RETNLBQ9BQ08 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC11.2□□□□□ -0.62
RETNLBQ9BQ08 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
RETNLBQ9BQ08 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
RETNLBQ9BQ08 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
RETNLBQ9BQ08 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
RETNLBQ9BQ08 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
RETNLBQ9BQ08 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
RETNLBQ9BQ08 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
RETNLBQ9BQ08 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
RETNLBQ9BQ08 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
RETNLBQ9BQ08 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
RETNLBQ9BQ08 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
RETNLBQ9BQ08 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
RETNLBQ9BQ08 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
RETNLBQ9BQ08 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
RETNLBQ9BQ08 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
RETNLBQ9BQ08 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
RETNLBQ9BQ08 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
RETNLBQ9BQ08 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
RETNLBQ9BQ08 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
RETNLBQ9BQ08 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
RETNLBQ9BQ08 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
RETNLBQ9BQ08 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
RETNLBQ9BQ08 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
RETNLBQ9BQ08 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
RETNLBQ9BQ08 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
RETNLBQ9BQ08 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
RETNLBQ9BQ08 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
RETNLBQ9BQ08 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
RETNLBQ9BQ08 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
RETNLBQ9BQ08 NBEA-203ENST00000379939 10738 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
RETNLBQ9BQ08 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
RETNLBQ9BQ08 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
RETNLBQ9BQ08 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
RETNLBQ9BQ08 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
RETNLBQ9BQ08 DIP2A-201ENST00000400274 7023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
RETNLBQ9BQ08 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
RETNLBQ9BQ08 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
RETNLBQ9BQ08 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
RETNLBQ9BQ08 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
RETNLBQ9BQ08 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
RETNLBQ9BQ08 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
RETNLBQ9BQ08 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
RETNLBQ9BQ08 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
RETNLBQ9BQ08 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
RETNLBQ9BQ08 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
RETNLBQ9BQ08 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
RETNLBQ9BQ08 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
RETNLBQ9BQ08 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
RETNLBQ9BQ08 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
RETNLBQ9BQ08 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
RETNLBQ9BQ08 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
RETNLBQ9BQ08 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
RETNLBQ9BQ08 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
RETNLBQ9BQ08 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
RETNLBQ9BQ08 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
RETNLBQ9BQ08 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
RETNLBQ9BQ08 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC11.19□□□□□ -0.62
RETNLBQ9BQ08 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
RETNLBQ9BQ08 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
RETNLBQ9BQ08 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC11.19□□□□□ -0.62
RETNLBQ9BQ08 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
RETNLBQ9BQ08 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
RETNLBQ9BQ08 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
RETNLBQ9BQ08 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
RETNLBQ9BQ08 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
RETNLBQ9BQ08 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
RETNLBQ9BQ08 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
RETNLBQ9BQ08 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
RETNLBQ9BQ08 NR3C1-203ENST00000394464 6795 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
RETNLBQ9BQ08 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
RETNLBQ9BQ08 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
RETNLBQ9BQ08 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
RETNLBQ9BQ08 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
RETNLBQ9BQ08 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
RETNLBQ9BQ08 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
RETNLBQ9BQ08 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
RETNLBQ9BQ08 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
RETNLBQ9BQ08 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
RETNLBQ9BQ08 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
RETNLBQ9BQ08 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
RETNLBQ9BQ08 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC11.18□□□□□ -0.62
RETNLBQ9BQ08 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
RETNLBQ9BQ08 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
RETNLBQ9BQ08 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
RETNLBQ9BQ08 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
RETNLBQ9BQ08 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
RETNLBQ9BQ08 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
RETNLBQ9BQ08 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
RETNLBQ9BQ08 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.18□□□□□ -0.62
RETNLBQ9BQ08 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC11.18□□□□□ -0.62
RETNLBQ9BQ08 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.18□□□□□ -0.62
RETNLBQ9BQ08 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
RETNLBQ9BQ08 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms