Protein–RNA interactions for Protein: Q96M60

FAM227B, Protein FAM227B, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM227BQ96M60 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FAM227BQ96M60 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FAM227BQ96M60 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FAM227BQ96M60 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FAM227BQ96M60 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FAM227BQ96M60 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
FAM227BQ96M60 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
FAM227BQ96M60 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
FAM227BQ96M60 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
FAM227BQ96M60 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
FAM227BQ96M60 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
FAM227BQ96M60 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
FAM227BQ96M60 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
FAM227BQ96M60 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
FAM227BQ96M60 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
FAM227BQ96M60 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
FAM227BQ96M60 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
FAM227BQ96M60 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
FAM227BQ96M60 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
FAM227BQ96M60 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
FAM227BQ96M60 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
FAM227BQ96M60 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
FAM227BQ96M60 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
FAM227BQ96M60 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
FAM227BQ96M60 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
FAM227BQ96M60 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
FAM227BQ96M60 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
FAM227BQ96M60 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
FAM227BQ96M60 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
FAM227BQ96M60 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
FAM227BQ96M60 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
FAM227BQ96M60 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
FAM227BQ96M60 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
FAM227BQ96M60 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
FAM227BQ96M60 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.21
FAM227BQ96M60 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
FAM227BQ96M60 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
FAM227BQ96M60 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
FAM227BQ96M60 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
FAM227BQ96M60 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
FAM227BQ96M60 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
FAM227BQ96M60 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
FAM227BQ96M60 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
FAM227BQ96M60 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
FAM227BQ96M60 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
FAM227BQ96M60 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
FAM227BQ96M60 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
FAM227BQ96M60 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
FAM227BQ96M60 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
FAM227BQ96M60 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
FAM227BQ96M60 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
FAM227BQ96M60 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
FAM227BQ96M60 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
FAM227BQ96M60 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
FAM227BQ96M60 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
FAM227BQ96M60 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
FAM227BQ96M60 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
FAM227BQ96M60 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
FAM227BQ96M60 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
FAM227BQ96M60 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
FAM227BQ96M60 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
FAM227BQ96M60 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
FAM227BQ96M60 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
FAM227BQ96M60 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
FAM227BQ96M60 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
FAM227BQ96M60 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
FAM227BQ96M60 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
FAM227BQ96M60 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
FAM227BQ96M60 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
FAM227BQ96M60 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
FAM227BQ96M60 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
FAM227BQ96M60 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
FAM227BQ96M60 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
FAM227BQ96M60 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
FAM227BQ96M60 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
FAM227BQ96M60 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
FAM227BQ96M60 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FAM227BQ96M60 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FAM227BQ96M60 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
FAM227BQ96M60 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FAM227BQ96M60 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
FAM227BQ96M60 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
FAM227BQ96M60 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FAM227BQ96M60 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FAM227BQ96M60 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
FAM227BQ96M60 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
FAM227BQ96M60 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
FAM227BQ96M60 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
FAM227BQ96M60 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
FAM227BQ96M60 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FAM227BQ96M60 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FAM227BQ96M60 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FAM227BQ96M60 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
FAM227BQ96M60 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FAM227BQ96M60 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FAM227BQ96M60 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FAM227BQ96M60 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
FAM227BQ96M60 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
FAM227BQ96M60 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
FAM227BQ96M60 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms