Protein–RNA interactions for Protein: Q8NDP4

ZNF439, Zinc finger protein 439, humanhuman

Predictions only

Length 499 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF439Q8NDP4 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ZNF439Q8NDP4 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ZNF439Q8NDP4 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ZNF439Q8NDP4 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ZNF439Q8NDP4 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ZNF439Q8NDP4 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ZNF439Q8NDP4 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ZNF439Q8NDP4 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ZNF439Q8NDP4 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
ZNF439Q8NDP4 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZNF439Q8NDP4 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZNF439Q8NDP4 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZNF439Q8NDP4 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZNF439Q8NDP4 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZNF439Q8NDP4 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZNF439Q8NDP4 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZNF439Q8NDP4 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZNF439Q8NDP4 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZNF439Q8NDP4 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZNF439Q8NDP4 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZNF439Q8NDP4 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
ZNF439Q8NDP4 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZNF439Q8NDP4 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZNF439Q8NDP4 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZNF439Q8NDP4 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
ZNF439Q8NDP4 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZNF439Q8NDP4 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZNF439Q8NDP4 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZNF439Q8NDP4 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZNF439Q8NDP4 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZNF439Q8NDP4 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
ZNF439Q8NDP4 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZNF439Q8NDP4 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZNF439Q8NDP4 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZNF439Q8NDP4 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZNF439Q8NDP4 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
ZNF439Q8NDP4 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZNF439Q8NDP4 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZNF439Q8NDP4 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZNF439Q8NDP4 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZNF439Q8NDP4 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZNF439Q8NDP4 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZNF439Q8NDP4 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZNF439Q8NDP4 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZNF439Q8NDP4 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZNF439Q8NDP4 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZNF439Q8NDP4 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZNF439Q8NDP4 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZNF439Q8NDP4 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZNF439Q8NDP4 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZNF439Q8NDP4 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZNF439Q8NDP4 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZNF439Q8NDP4 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZNF439Q8NDP4 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZNF439Q8NDP4 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZNF439Q8NDP4 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZNF439Q8NDP4 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZNF439Q8NDP4 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZNF439Q8NDP4 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZNF439Q8NDP4 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZNF439Q8NDP4 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
ZNF439Q8NDP4 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZNF439Q8NDP4 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZNF439Q8NDP4 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
ZNF439Q8NDP4 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZNF439Q8NDP4 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
ZNF439Q8NDP4 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
ZNF439Q8NDP4 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZNF439Q8NDP4 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZNF439Q8NDP4 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZNF439Q8NDP4 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZNF439Q8NDP4 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZNF439Q8NDP4 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZNF439Q8NDP4 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZNF439Q8NDP4 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZNF439Q8NDP4 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZNF439Q8NDP4 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZNF439Q8NDP4 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZNF439Q8NDP4 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZNF439Q8NDP4 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZNF439Q8NDP4 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZNF439Q8NDP4 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZNF439Q8NDP4 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZNF439Q8NDP4 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZNF439Q8NDP4 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZNF439Q8NDP4 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZNF439Q8NDP4 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNF439Q8NDP4 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNF439Q8NDP4 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNF439Q8NDP4 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNF439Q8NDP4 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNF439Q8NDP4 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNF439Q8NDP4 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNF439Q8NDP4 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNF439Q8NDP4 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNF439Q8NDP4 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNF439Q8NDP4 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNF439Q8NDP4 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNF439Q8NDP4 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNF439Q8NDP4 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms