Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4V2

SVOP, Synaptic vesicle 2-related protein, humanhuman

Predictions only

Length 548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SVOPQ8N4V2 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SVOPQ8N4V2 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SVOPQ8N4V2 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SVOPQ8N4V2 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SVOPQ8N4V2 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SVOPQ8N4V2 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SVOPQ8N4V2 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SVOPQ8N4V2 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SVOPQ8N4V2 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SVOPQ8N4V2 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SVOPQ8N4V2 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SVOPQ8N4V2 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SVOPQ8N4V2 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SVOPQ8N4V2 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SVOPQ8N4V2 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SVOPQ8N4V2 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
SVOPQ8N4V2 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SVOPQ8N4V2 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SVOPQ8N4V2 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SVOPQ8N4V2 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SVOPQ8N4V2 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SVOPQ8N4V2 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SVOPQ8N4V2 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SVOPQ8N4V2 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SVOPQ8N4V2 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SVOPQ8N4V2 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SVOPQ8N4V2 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SVOPQ8N4V2 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SVOPQ8N4V2 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SVOPQ8N4V2 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SVOPQ8N4V2 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SVOPQ8N4V2 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SVOPQ8N4V2 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SVOPQ8N4V2 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SVOPQ8N4V2 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SVOPQ8N4V2 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SVOPQ8N4V2 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SVOPQ8N4V2 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SVOPQ8N4V2 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SVOPQ8N4V2 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SVOPQ8N4V2 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SVOPQ8N4V2 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SVOPQ8N4V2 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
SVOPQ8N4V2 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
SVOPQ8N4V2 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
SVOPQ8N4V2 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.34
SVOPQ8N4V2 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
SVOPQ8N4V2 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SVOPQ8N4V2 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SVOPQ8N4V2 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
SVOPQ8N4V2 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SVOPQ8N4V2 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SVOPQ8N4V2 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SVOPQ8N4V2 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SVOPQ8N4V2 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SVOPQ8N4V2 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SVOPQ8N4V2 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SVOPQ8N4V2 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SVOPQ8N4V2 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SVOPQ8N4V2 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SVOPQ8N4V2 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SVOPQ8N4V2 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SVOPQ8N4V2 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
SVOPQ8N4V2 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SVOPQ8N4V2 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SVOPQ8N4V2 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SVOPQ8N4V2 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SVOPQ8N4V2 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SVOPQ8N4V2 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SVOPQ8N4V2 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SVOPQ8N4V2 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SVOPQ8N4V2 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SVOPQ8N4V2 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SVOPQ8N4V2 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
SVOPQ8N4V2 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SVOPQ8N4V2 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SVOPQ8N4V2 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SVOPQ8N4V2 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
SVOPQ8N4V2 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SVOPQ8N4V2 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SVOPQ8N4V2 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SVOPQ8N4V2 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SVOPQ8N4V2 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SVOPQ8N4V2 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SVOPQ8N4V2 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SVOPQ8N4V2 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SVOPQ8N4V2 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SVOPQ8N4V2 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SVOPQ8N4V2 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SVOPQ8N4V2 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SVOPQ8N4V2 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SVOPQ8N4V2 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SVOPQ8N4V2 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SVOPQ8N4V2 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SVOPQ8N4V2 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SVOPQ8N4V2 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SVOPQ8N4V2 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SVOPQ8N4V2 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SVOPQ8N4V2 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SVOPQ8N4V2 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms