Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXW0

LMNTD2, Lamin tail domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMNTD2Q8IXW0 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
LMNTD2Q8IXW0 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
LMNTD2Q8IXW0 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
LMNTD2Q8IXW0 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
LMNTD2Q8IXW0 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
LMNTD2Q8IXW0 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
LMNTD2Q8IXW0 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
LMNTD2Q8IXW0 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
LMNTD2Q8IXW0 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
LMNTD2Q8IXW0 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
LMNTD2Q8IXW0 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
LMNTD2Q8IXW0 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
LMNTD2Q8IXW0 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
LMNTD2Q8IXW0 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
LMNTD2Q8IXW0 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
LMNTD2Q8IXW0 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
LMNTD2Q8IXW0 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
LMNTD2Q8IXW0 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
LMNTD2Q8IXW0 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
LMNTD2Q8IXW0 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
LMNTD2Q8IXW0 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
LMNTD2Q8IXW0 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
LMNTD2Q8IXW0 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.2■□□□□ 0.66
LMNTD2Q8IXW0 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
LMNTD2Q8IXW0 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
LMNTD2Q8IXW0 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
LMNTD2Q8IXW0 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
LMNTD2Q8IXW0 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
LMNTD2Q8IXW0 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
LMNTD2Q8IXW0 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
LMNTD2Q8IXW0 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
LMNTD2Q8IXW0 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
LMNTD2Q8IXW0 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
LMNTD2Q8IXW0 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
LMNTD2Q8IXW0 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
LMNTD2Q8IXW0 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
LMNTD2Q8IXW0 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
LMNTD2Q8IXW0 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
LMNTD2Q8IXW0 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
LMNTD2Q8IXW0 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
LMNTD2Q8IXW0 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
LMNTD2Q8IXW0 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
LMNTD2Q8IXW0 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
LMNTD2Q8IXW0 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
LMNTD2Q8IXW0 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
LMNTD2Q8IXW0 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
LMNTD2Q8IXW0 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
LMNTD2Q8IXW0 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
LMNTD2Q8IXW0 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
LMNTD2Q8IXW0 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
LMNTD2Q8IXW0 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
LMNTD2Q8IXW0 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
LMNTD2Q8IXW0 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
LMNTD2Q8IXW0 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
LMNTD2Q8IXW0 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
LMNTD2Q8IXW0 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
LMNTD2Q8IXW0 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
LMNTD2Q8IXW0 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
LMNTD2Q8IXW0 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
LMNTD2Q8IXW0 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
LMNTD2Q8IXW0 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
LMNTD2Q8IXW0 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
LMNTD2Q8IXW0 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
LMNTD2Q8IXW0 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
LMNTD2Q8IXW0 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
LMNTD2Q8IXW0 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
LMNTD2Q8IXW0 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
LMNTD2Q8IXW0 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
LMNTD2Q8IXW0 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
LMNTD2Q8IXW0 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
LMNTD2Q8IXW0 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
LMNTD2Q8IXW0 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
LMNTD2Q8IXW0 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
LMNTD2Q8IXW0 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
LMNTD2Q8IXW0 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
LMNTD2Q8IXW0 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
LMNTD2Q8IXW0 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
LMNTD2Q8IXW0 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
LMNTD2Q8IXW0 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
LMNTD2Q8IXW0 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
LMNTD2Q8IXW0 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
LMNTD2Q8IXW0 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
LMNTD2Q8IXW0 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
LMNTD2Q8IXW0 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
LMNTD2Q8IXW0 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
LMNTD2Q8IXW0 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
LMNTD2Q8IXW0 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
LMNTD2Q8IXW0 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
LMNTD2Q8IXW0 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
LMNTD2Q8IXW0 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
LMNTD2Q8IXW0 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
LMNTD2Q8IXW0 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
LMNTD2Q8IXW0 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
LMNTD2Q8IXW0 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
LMNTD2Q8IXW0 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
LMNTD2Q8IXW0 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
LMNTD2Q8IXW0 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
LMNTD2Q8IXW0 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
LMNTD2Q8IXW0 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
LMNTD2Q8IXW0 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms