Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVB4

SLC9A9, Sodium/hydrogen exchanger 9, humanhuman

Predictions only

Length 645 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC9A9Q8IVB4 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SLC9A9Q8IVB4 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
SLC9A9Q8IVB4 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SLC9A9Q8IVB4 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SLC9A9Q8IVB4 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SLC9A9Q8IVB4 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
SLC9A9Q8IVB4 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
SLC9A9Q8IVB4 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
SLC9A9Q8IVB4 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
SLC9A9Q8IVB4 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SLC9A9Q8IVB4 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SLC9A9Q8IVB4 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SLC9A9Q8IVB4 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SLC9A9Q8IVB4 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SLC9A9Q8IVB4 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SLC9A9Q8IVB4 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SLC9A9Q8IVB4 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SLC9A9Q8IVB4 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SLC9A9Q8IVB4 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SLC9A9Q8IVB4 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SLC9A9Q8IVB4 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SLC9A9Q8IVB4 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SLC9A9Q8IVB4 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SLC9A9Q8IVB4 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SLC9A9Q8IVB4 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
SLC9A9Q8IVB4 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
SLC9A9Q8IVB4 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SLC9A9Q8IVB4 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SLC9A9Q8IVB4 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SLC9A9Q8IVB4 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SLC9A9Q8IVB4 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SLC9A9Q8IVB4 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
SLC9A9Q8IVB4 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SLC9A9Q8IVB4 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SLC9A9Q8IVB4 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SLC9A9Q8IVB4 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SLC9A9Q8IVB4 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SLC9A9Q8IVB4 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SLC9A9Q8IVB4 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SLC9A9Q8IVB4 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SLC9A9Q8IVB4 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SLC9A9Q8IVB4 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SLC9A9Q8IVB4 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SLC9A9Q8IVB4 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SLC9A9Q8IVB4 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SLC9A9Q8IVB4 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SLC9A9Q8IVB4 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
SLC9A9Q8IVB4 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SLC9A9Q8IVB4 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SLC9A9Q8IVB4 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SLC9A9Q8IVB4 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SLC9A9Q8IVB4 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
SLC9A9Q8IVB4 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SLC9A9Q8IVB4 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SLC9A9Q8IVB4 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SLC9A9Q8IVB4 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SLC9A9Q8IVB4 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SLC9A9Q8IVB4 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SLC9A9Q8IVB4 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SLC9A9Q8IVB4 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SLC9A9Q8IVB4 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SLC9A9Q8IVB4 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SLC9A9Q8IVB4 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SLC9A9Q8IVB4 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SLC9A9Q8IVB4 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SLC9A9Q8IVB4 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SLC9A9Q8IVB4 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SLC9A9Q8IVB4 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SLC9A9Q8IVB4 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SLC9A9Q8IVB4 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SLC9A9Q8IVB4 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SLC9A9Q8IVB4 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SLC9A9Q8IVB4 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SLC9A9Q8IVB4 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SLC9A9Q8IVB4 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SLC9A9Q8IVB4 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
SLC9A9Q8IVB4 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SLC9A9Q8IVB4 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SLC9A9Q8IVB4 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SLC9A9Q8IVB4 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SLC9A9Q8IVB4 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SLC9A9Q8IVB4 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SLC9A9Q8IVB4 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SLC9A9Q8IVB4 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SLC9A9Q8IVB4 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SLC9A9Q8IVB4 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SLC9A9Q8IVB4 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SLC9A9Q8IVB4 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SLC9A9Q8IVB4 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SLC9A9Q8IVB4 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SLC9A9Q8IVB4 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SLC9A9Q8IVB4 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SLC9A9Q8IVB4 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SLC9A9Q8IVB4 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SLC9A9Q8IVB4 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SLC9A9Q8IVB4 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SLC9A9Q8IVB4 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SLC9A9Q8IVB4 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SLC9A9Q8IVB4 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SLC9A9Q8IVB4 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms