Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1M0

SLC27A4, Long-chain fatty acid transport protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 643 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC27A4Q6P1M0 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC27A4Q6P1M0 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC27A4Q6P1M0 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC27A4Q6P1M0 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC27A4Q6P1M0 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC27A4Q6P1M0 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC27A4Q6P1M0 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC27A4Q6P1M0 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC27A4Q6P1M0 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC27A4Q6P1M0 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC27A4Q6P1M0 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC27A4Q6P1M0 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC27A4Q6P1M0 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC27A4Q6P1M0 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC27A4Q6P1M0 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC27A4Q6P1M0 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC27A4Q6P1M0 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC27A4Q6P1M0 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC27A4Q6P1M0 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC27A4Q6P1M0 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC27A4Q6P1M0 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC27A4Q6P1M0 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC27A4Q6P1M0 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC27A4Q6P1M0 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC27A4Q6P1M0 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC27A4Q6P1M0 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC27A4Q6P1M0 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC27A4Q6P1M0 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC27A4Q6P1M0 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC27A4Q6P1M0 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC27A4Q6P1M0 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC27A4Q6P1M0 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC27A4Q6P1M0 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC27A4Q6P1M0 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC27A4Q6P1M0 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC27A4Q6P1M0 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC27A4Q6P1M0 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC27A4Q6P1M0 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC27A4Q6P1M0 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC27A4Q6P1M0 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC27A4Q6P1M0 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC27A4Q6P1M0 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC27A4Q6P1M0 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC27A4Q6P1M0 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC27A4Q6P1M0 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC27A4Q6P1M0 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC27A4Q6P1M0 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC27A4Q6P1M0 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC27A4Q6P1M0 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC27A4Q6P1M0 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC27A4Q6P1M0 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC27A4Q6P1M0 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC27A4Q6P1M0 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC27A4Q6P1M0 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC27A4Q6P1M0 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC27A4Q6P1M0 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC27A4Q6P1M0 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC27A4Q6P1M0 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC27A4Q6P1M0 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC27A4Q6P1M0 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC27A4Q6P1M0 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC27A4Q6P1M0 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC27A4Q6P1M0 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC27A4Q6P1M0 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC27A4Q6P1M0 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC27A4Q6P1M0 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC27A4Q6P1M0 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC27A4Q6P1M0 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC27A4Q6P1M0 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC27A4Q6P1M0 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC27A4Q6P1M0 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC27A4Q6P1M0 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC27A4Q6P1M0 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC27A4Q6P1M0 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC27A4Q6P1M0 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC27A4Q6P1M0 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC27A4Q6P1M0 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC27A4Q6P1M0 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC27A4Q6P1M0 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC27A4Q6P1M0 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC27A4Q6P1M0 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC27A4Q6P1M0 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC27A4Q6P1M0 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC27A4Q6P1M0 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC27A4Q6P1M0 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC27A4Q6P1M0 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC27A4Q6P1M0 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC27A4Q6P1M0 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC27A4Q6P1M0 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC27A4Q6P1M0 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC27A4Q6P1M0 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC27A4Q6P1M0 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.34
SLC27A4Q6P1M0 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SLC27A4Q6P1M0 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SLC27A4Q6P1M0 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SLC27A4Q6P1M0 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SLC27A4Q6P1M0 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SLC27A4Q6P1M0 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SLC27A4Q6P1M0 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SLC27A4Q6P1M0 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.5 ms