Protein–RNA interactions for Protein: Q6L9W6

B4GALNT3, Beta-1,4-N-acetylgalactosaminyltransferase 3, humanhuman

Predictions only

Length 998 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B4GALNT3Q6L9W6 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
B4GALNT3Q6L9W6 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
B4GALNT3Q6L9W6 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
B4GALNT3Q6L9W6 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
B4GALNT3Q6L9W6 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
B4GALNT3Q6L9W6 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
B4GALNT3Q6L9W6 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
B4GALNT3Q6L9W6 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
B4GALNT3Q6L9W6 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
B4GALNT3Q6L9W6 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
B4GALNT3Q6L9W6 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
B4GALNT3Q6L9W6 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
B4GALNT3Q6L9W6 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
B4GALNT3Q6L9W6 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
B4GALNT3Q6L9W6 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
B4GALNT3Q6L9W6 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
B4GALNT3Q6L9W6 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
B4GALNT3Q6L9W6 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
B4GALNT3Q6L9W6 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
B4GALNT3Q6L9W6 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
B4GALNT3Q6L9W6 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
B4GALNT3Q6L9W6 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
B4GALNT3Q6L9W6 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
B4GALNT3Q6L9W6 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
B4GALNT3Q6L9W6 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
B4GALNT3Q6L9W6 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
B4GALNT3Q6L9W6 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
B4GALNT3Q6L9W6 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
B4GALNT3Q6L9W6 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
B4GALNT3Q6L9W6 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
B4GALNT3Q6L9W6 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
B4GALNT3Q6L9W6 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
B4GALNT3Q6L9W6 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
B4GALNT3Q6L9W6 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
B4GALNT3Q6L9W6 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
B4GALNT3Q6L9W6 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
B4GALNT3Q6L9W6 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
B4GALNT3Q6L9W6 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
B4GALNT3Q6L9W6 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC24.27■■□□□ 1.48
B4GALNT3Q6L9W6 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
B4GALNT3Q6L9W6 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
B4GALNT3Q6L9W6 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
B4GALNT3Q6L9W6 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC24.27■■□□□ 1.48
B4GALNT3Q6L9W6 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
B4GALNT3Q6L9W6 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
B4GALNT3Q6L9W6 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
B4GALNT3Q6L9W6 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
B4GALNT3Q6L9W6 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
B4GALNT3Q6L9W6 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
B4GALNT3Q6L9W6 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
B4GALNT3Q6L9W6 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
B4GALNT3Q6L9W6 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
B4GALNT3Q6L9W6 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
B4GALNT3Q6L9W6 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
B4GALNT3Q6L9W6 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
B4GALNT3Q6L9W6 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
B4GALNT3Q6L9W6 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
B4GALNT3Q6L9W6 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
B4GALNT3Q6L9W6 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
B4GALNT3Q6L9W6 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
B4GALNT3Q6L9W6 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
B4GALNT3Q6L9W6 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
B4GALNT3Q6L9W6 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
B4GALNT3Q6L9W6 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
B4GALNT3Q6L9W6 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
B4GALNT3Q6L9W6 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
B4GALNT3Q6L9W6 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
B4GALNT3Q6L9W6 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
B4GALNT3Q6L9W6 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
B4GALNT3Q6L9W6 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
B4GALNT3Q6L9W6 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
B4GALNT3Q6L9W6 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
B4GALNT3Q6L9W6 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
B4GALNT3Q6L9W6 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
B4GALNT3Q6L9W6 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
B4GALNT3Q6L9W6 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
B4GALNT3Q6L9W6 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
B4GALNT3Q6L9W6 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
B4GALNT3Q6L9W6 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
B4GALNT3Q6L9W6 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
B4GALNT3Q6L9W6 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
B4GALNT3Q6L9W6 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
B4GALNT3Q6L9W6 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
B4GALNT3Q6L9W6 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
B4GALNT3Q6L9W6 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
B4GALNT3Q6L9W6 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
B4GALNT3Q6L9W6 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
B4GALNT3Q6L9W6 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
B4GALNT3Q6L9W6 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
B4GALNT3Q6L9W6 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
B4GALNT3Q6L9W6 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
B4GALNT3Q6L9W6 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
B4GALNT3Q6L9W6 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
B4GALNT3Q6L9W6 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
B4GALNT3Q6L9W6 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
B4GALNT3Q6L9W6 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
B4GALNT3Q6L9W6 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
B4GALNT3Q6L9W6 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
B4GALNT3Q6L9W6 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
B4GALNT3Q6L9W6 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms