Protein–RNA interactions for Protein: Q5SRN2

C6orf10, Uncharacterized protein C6orf10, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C6orf10Q5SRN2 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
C6orf10Q5SRN2 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
C6orf10Q5SRN2 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
C6orf10Q5SRN2 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
C6orf10Q5SRN2 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
C6orf10Q5SRN2 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
C6orf10Q5SRN2 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
C6orf10Q5SRN2 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
C6orf10Q5SRN2 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
C6orf10Q5SRN2 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
C6orf10Q5SRN2 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
C6orf10Q5SRN2 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
C6orf10Q5SRN2 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
C6orf10Q5SRN2 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
C6orf10Q5SRN2 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
C6orf10Q5SRN2 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
C6orf10Q5SRN2 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
C6orf10Q5SRN2 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
C6orf10Q5SRN2 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
C6orf10Q5SRN2 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
C6orf10Q5SRN2 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
C6orf10Q5SRN2 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
C6orf10Q5SRN2 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
C6orf10Q5SRN2 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
C6orf10Q5SRN2 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
C6orf10Q5SRN2 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
C6orf10Q5SRN2 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
C6orf10Q5SRN2 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
C6orf10Q5SRN2 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
C6orf10Q5SRN2 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
C6orf10Q5SRN2 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
C6orf10Q5SRN2 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
C6orf10Q5SRN2 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
C6orf10Q5SRN2 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
C6orf10Q5SRN2 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
C6orf10Q5SRN2 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
C6orf10Q5SRN2 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
C6orf10Q5SRN2 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
C6orf10Q5SRN2 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
C6orf10Q5SRN2 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
C6orf10Q5SRN2 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
C6orf10Q5SRN2 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
C6orf10Q5SRN2 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
C6orf10Q5SRN2 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
C6orf10Q5SRN2 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
C6orf10Q5SRN2 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
C6orf10Q5SRN2 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
C6orf10Q5SRN2 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
C6orf10Q5SRN2 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
C6orf10Q5SRN2 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
C6orf10Q5SRN2 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
C6orf10Q5SRN2 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
C6orf10Q5SRN2 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
C6orf10Q5SRN2 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
C6orf10Q5SRN2 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
C6orf10Q5SRN2 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
C6orf10Q5SRN2 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
C6orf10Q5SRN2 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
C6orf10Q5SRN2 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
C6orf10Q5SRN2 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
C6orf10Q5SRN2 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
C6orf10Q5SRN2 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
C6orf10Q5SRN2 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
C6orf10Q5SRN2 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
C6orf10Q5SRN2 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
C6orf10Q5SRN2 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
C6orf10Q5SRN2 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
C6orf10Q5SRN2 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
C6orf10Q5SRN2 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
C6orf10Q5SRN2 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
C6orf10Q5SRN2 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
C6orf10Q5SRN2 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
C6orf10Q5SRN2 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
C6orf10Q5SRN2 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
C6orf10Q5SRN2 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
C6orf10Q5SRN2 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
C6orf10Q5SRN2 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
C6orf10Q5SRN2 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
C6orf10Q5SRN2 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
C6orf10Q5SRN2 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
C6orf10Q5SRN2 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
C6orf10Q5SRN2 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
C6orf10Q5SRN2 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
C6orf10Q5SRN2 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
C6orf10Q5SRN2 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
C6orf10Q5SRN2 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
C6orf10Q5SRN2 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
C6orf10Q5SRN2 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
C6orf10Q5SRN2 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
C6orf10Q5SRN2 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
C6orf10Q5SRN2 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
C6orf10Q5SRN2 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
C6orf10Q5SRN2 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
C6orf10Q5SRN2 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
C6orf10Q5SRN2 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
C6orf10Q5SRN2 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
C6orf10Q5SRN2 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
C6orf10Q5SRN2 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
C6orf10Q5SRN2 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
C6orf10Q5SRN2 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms