Protein–RNA interactions for Protein: Q5JTW2

CEP78, Centrosomal protein of 78 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 689 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP78Q5JTW2 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CEP78Q5JTW2 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CEP78Q5JTW2 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CEP78Q5JTW2 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CEP78Q5JTW2 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CEP78Q5JTW2 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CEP78Q5JTW2 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
CEP78Q5JTW2 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
CEP78Q5JTW2 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
CEP78Q5JTW2 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CEP78Q5JTW2 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CEP78Q5JTW2 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CEP78Q5JTW2 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CEP78Q5JTW2 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CEP78Q5JTW2 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CEP78Q5JTW2 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CEP78Q5JTW2 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CEP78Q5JTW2 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CEP78Q5JTW2 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CEP78Q5JTW2 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CEP78Q5JTW2 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CEP78Q5JTW2 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CEP78Q5JTW2 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CEP78Q5JTW2 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CEP78Q5JTW2 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CEP78Q5JTW2 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CEP78Q5JTW2 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CEP78Q5JTW2 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CEP78Q5JTW2 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CEP78Q5JTW2 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CEP78Q5JTW2 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CEP78Q5JTW2 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CEP78Q5JTW2 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CEP78Q5JTW2 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CEP78Q5JTW2 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CEP78Q5JTW2 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CEP78Q5JTW2 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CEP78Q5JTW2 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CEP78Q5JTW2 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
CEP78Q5JTW2 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CEP78Q5JTW2 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CEP78Q5JTW2 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CEP78Q5JTW2 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CEP78Q5JTW2 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CEP78Q5JTW2 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
CEP78Q5JTW2 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CEP78Q5JTW2 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CEP78Q5JTW2 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CEP78Q5JTW2 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CEP78Q5JTW2 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CEP78Q5JTW2 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CEP78Q5JTW2 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CEP78Q5JTW2 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CEP78Q5JTW2 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CEP78Q5JTW2 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CEP78Q5JTW2 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CEP78Q5JTW2 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CEP78Q5JTW2 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CEP78Q5JTW2 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CEP78Q5JTW2 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CEP78Q5JTW2 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
CEP78Q5JTW2 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CEP78Q5JTW2 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CEP78Q5JTW2 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CEP78Q5JTW2 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
CEP78Q5JTW2 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CEP78Q5JTW2 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CEP78Q5JTW2 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CEP78Q5JTW2 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CEP78Q5JTW2 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CEP78Q5JTW2 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CEP78Q5JTW2 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CEP78Q5JTW2 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CEP78Q5JTW2 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CEP78Q5JTW2 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CEP78Q5JTW2 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CEP78Q5JTW2 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CEP78Q5JTW2 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CEP78Q5JTW2 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CEP78Q5JTW2 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CEP78Q5JTW2 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CEP78Q5JTW2 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CEP78Q5JTW2 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CEP78Q5JTW2 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CEP78Q5JTW2 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CEP78Q5JTW2 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CEP78Q5JTW2 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CEP78Q5JTW2 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CEP78Q5JTW2 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CEP78Q5JTW2 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CEP78Q5JTW2 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CEP78Q5JTW2 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CEP78Q5JTW2 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CEP78Q5JTW2 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CEP78Q5JTW2 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CEP78Q5JTW2 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CEP78Q5JTW2 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CEP78Q5JTW2 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CEP78Q5JTW2 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CEP78Q5JTW2 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms