Protein–RNA interactions for Protein: Q504U0

C4orf46, Renal cancer differentiation gene 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4orf46Q504U0 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
C4orf46Q504U0 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
C4orf46Q504U0 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
C4orf46Q504U0 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
C4orf46Q504U0 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
C4orf46Q504U0 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C4orf46Q504U0 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC16■□□□□ 0.15
C4orf46Q504U0 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C4orf46Q504U0 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
C4orf46Q504U0 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C4orf46Q504U0 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
C4orf46Q504U0 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C4orf46Q504U0 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
C4orf46Q504U0 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
C4orf46Q504U0 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC16■□□□□ 0.15
C4orf46Q504U0 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
C4orf46Q504U0 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C4orf46Q504U0 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
C4orf46Q504U0 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C4orf46Q504U0 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C4orf46Q504U0 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
C4orf46Q504U0 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C4orf46Q504U0 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
C4orf46Q504U0 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
C4orf46Q504U0 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C4orf46Q504U0 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C4orf46Q504U0 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
C4orf46Q504U0 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
C4orf46Q504U0 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C4orf46Q504U0 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC16■□□□□ 0.15
C4orf46Q504U0 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C4orf46Q504U0 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
C4orf46Q504U0 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C4orf46Q504U0 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C4orf46Q504U0 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C4orf46Q504U0 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
C4orf46Q504U0 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C4orf46Q504U0 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C4orf46Q504U0 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
C4orf46Q504U0 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC16■□□□□ 0.15
C4orf46Q504U0 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C4orf46Q504U0 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
C4orf46Q504U0 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
C4orf46Q504U0 BRSK1-206ENST00000590333 2977 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
C4orf46Q504U0 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
C4orf46Q504U0 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
C4orf46Q504U0 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
C4orf46Q504U0 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
C4orf46Q504U0 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
C4orf46Q504U0 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
C4orf46Q504U0 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
C4orf46Q504U0 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
C4orf46Q504U0 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
C4orf46Q504U0 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
C4orf46Q504U0 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
C4orf46Q504U0 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
C4orf46Q504U0 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
C4orf46Q504U0 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
C4orf46Q504U0 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
C4orf46Q504U0 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
C4orf46Q504U0 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
C4orf46Q504U0 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
C4orf46Q504U0 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
C4orf46Q504U0 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
C4orf46Q504U0 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
C4orf46Q504U0 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
C4orf46Q504U0 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
C4orf46Q504U0 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
C4orf46Q504U0 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
C4orf46Q504U0 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
C4orf46Q504U0 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
C4orf46Q504U0 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
C4orf46Q504U0 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
C4orf46Q504U0 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
C4orf46Q504U0 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
C4orf46Q504U0 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
C4orf46Q504U0 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
C4orf46Q504U0 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
C4orf46Q504U0 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
C4orf46Q504U0 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
C4orf46Q504U0 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
C4orf46Q504U0 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
C4orf46Q504U0 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
C4orf46Q504U0 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
C4orf46Q504U0 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
C4orf46Q504U0 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
C4orf46Q504U0 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
C4orf46Q504U0 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
C4orf46Q504U0 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
C4orf46Q504U0 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
C4orf46Q504U0 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
C4orf46Q504U0 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
C4orf46Q504U0 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
C4orf46Q504U0 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
C4orf46Q504U0 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
C4orf46Q504U0 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
C4orf46Q504U0 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
C4orf46Q504U0 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
C4orf46Q504U0 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
C4orf46Q504U0 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms