Protein–RNA interactions for Protein: Q16384

SSX1, Protein SSX1, humanhuman

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Length 188 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSX1Q16384 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SSX1Q16384 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SSX1Q16384 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SSX1Q16384 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SSX1Q16384 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SSX1Q16384 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SSX1Q16384 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SSX1Q16384 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
SSX1Q16384 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SSX1Q16384 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SSX1Q16384 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SSX1Q16384 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SSX1Q16384 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SSX1Q16384 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SSX1Q16384 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
SSX1Q16384 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SSX1Q16384 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
SSX1Q16384 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SSX1Q16384 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SSX1Q16384 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SSX1Q16384 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
SSX1Q16384 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SSX1Q16384 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SSX1Q16384 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SSX1Q16384 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SSX1Q16384 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
SSX1Q16384 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SSX1Q16384 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SSX1Q16384 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SSX1Q16384 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SSX1Q16384 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SSX1Q16384 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SSX1Q16384 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SSX1Q16384 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SSX1Q16384 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SSX1Q16384 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SSX1Q16384 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SSX1Q16384 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
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SSX1Q16384 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SSX1Q16384 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SSX1Q16384 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
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SSX1Q16384 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SSX1Q16384 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SSX1Q16384 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SSX1Q16384 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SSX1Q16384 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SSX1Q16384 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
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SSX1Q16384 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
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SSX1Q16384 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
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SSX1Q16384 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
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SSX1Q16384 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SSX1Q16384 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SSX1Q16384 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SSX1Q16384 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SSX1Q16384 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SSX1Q16384 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SSX1Q16384 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SSX1Q16384 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SSX1Q16384 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SSX1Q16384 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SSX1Q16384 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SSX1Q16384 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SSX1Q16384 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SSX1Q16384 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SSX1Q16384 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SSX1Q16384 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SSX1Q16384 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SSX1Q16384 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SSX1Q16384 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
SSX1Q16384 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
SSX1Q16384 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
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