Protein–RNA interactions for Protein: Q14671

PUM1, Pumilio homolog 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 1,186 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUM1Q14671 ABCA7-203ENST00000435683 6211 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.15e-8■□□□□ 9.4
PUM1Q14671 ABCA7-202ENST00000433129 6704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.25e-8■□□□□ 9.4
PUM1Q14671 PLXNB2-207ENST00000449103 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.25e-8■□□□□ 9.4
PUM1Q14671 PLXNB2-201ENST00000359337 6335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.245e-8■□□□□ 9.4
PUM1Q14671 TCF25-223ENST00000568870 263 ntTSL 213.42□□□□□ -0.265e-8■□□□□ 9.4
PUM1Q14671 PRPF8-206ENST00000572723 959 ntTSL 212.56□□□□□ -0.45e-8■□□□□ 9.4
PUM1Q14671 PLXNB2-209ENST00000479701 3504 ntTSL 212.46□□□□□ -0.425e-8■□□□□ 9.4
PUM1Q14671 PLXNB2-208ENST00000463165 3038 ntTSL 212.42□□□□□ -0.425e-8■□□□□ 9.4
PUM1Q14671 PLXNB2-213ENST00000610984 3443 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.715e-8■□□□□ 9.4
PUM1Q14671 IWS1-212ENST00000637187 1021 ntTSL 56.32□□□□□ -1.45e-8■□□□□ 9.4
PUM1Q14671 GNAS-202ENST00000306090 477 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.557e-15■□□□□ 9.4
PUM1Q14671 PGGHG-208ENST00000529087 745 ntTSL 217.75■□□□□ 0.432e-6■□□□□ 9.4
PUM1Q14671 FBL-205ENST00000595545 896 ntTSL 29.39□□□□□ -0.914e-6■□□□□ 9.4
PUM1Q14671 SMARCA4-211ENST00000586921 569 ntTSL 515.28■□□□□ 0.042e-9■□□□□ 9.4
PUM1Q14671 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.422e-6■□□□□ 9.4
PUM1Q14671 GOLGA8A-203ENST00000473125 6233 ntTSL 1 (best)10.75□□□□□ -0.697e-11■□□□□ 9.4
PUM1Q14671 ZC3H15-202ENST00000421536 1101 ntTSL 28.44□□□□□ -1.067e-12■□□□□ 9.4
PUM1Q14671 ZC3H15-201ENST00000337859 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.16□□□□□ -1.17e-12■□□□□ 9.4
PUM1Q14671 BRD2-209ENST00000469132 1628 ntTSL 218.6■□□□□ 0.574e-7■□□□□ 9.3
PUM1Q14671 RPLP2-202ENST00000524867 598 ntTSL 226.21■■□□□ 1.795e-55■□□□□ 9.3
PUM1Q14671 THOC5-205ENST00000414902 484 ntTSL 514.96□□□□□ -0.015e-7■□□□□ 9.3
PUM1Q14671 THOC5-207ENST00000428374 729 ntTSL 213.05□□□□□ -0.325e-7■□□□□ 9.3
PUM1Q14671 THOC5-206ENST00000418021 738 ntTSL 310.94□□□□□ -0.665e-7■□□□□ 9.3
PUM1Q14671 THOC5-211ENST00000455450 579 ntTSL 310.37□□□□□ -0.755e-7■□□□□ 9.3
PUM1Q14671 HNRNPD-205ENST00000507010 748 ntTSL 326.32■■□□□ 1.83e-10■□□□□ 9.3
PUM1Q14671 HNRNPD-204ENST00000503822 607 ntTSL 524.63■■□□□ 1.533e-10■□□□□ 9.3
PUM1Q14671 HNRNPD-209ENST00000513584 1240 ntTSL 224.23■■□□□ 1.473e-10■□□□□ 9.3
PUM1Q14671 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.213e-10■□□□□ 9.3
PUM1Q14671 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.013e-10■□□□□ 9.3
PUM1Q14671 HNRNPD-207ENST00000509107 583 ntTSL 521.23■□□□□ 0.993e-10■□□□□ 9.3
PUM1Q14671 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.293e-10■□□□□ 9.3
PUM1Q14671 HNRNPD-212ENST00000515432 545 ntTSL 59.07□□□□□ -0.963e-10■□□□□ 9.3
PUM1Q14671 KARS-201ENST00000302445 2005 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.313e-6■□□□□ 9.3
PUM1Q14671 KARS-204ENST00000564578 1942 ntTSL 512.1□□□□□ -0.473e-6■□□□□ 9.3
PUM1Q14671 KARS-209ENST00000568378 459 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.593e-6■□□□□ 9.3
PUM1Q14671 KARS-202ENST00000319410 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.863e-6■□□□□ 9.3
PUM1Q14671 CCDC12-205ENST00000488069 897 ntTSL 219■□□□□ 0.635e-8■□□□□ 9.3
PUM1Q14671 CCDC12-208ENST00000603885 560 ntTSL 319■□□□□ 0.635e-8■□□□□ 9.3
PUM1Q14671 HNRNPUL1-206ENST00000594207 816 ntTSL 511.61□□□□□ -0.558e-8■□□□□ 9.3
PUM1Q14671 HNRNPUL1-211ENST00000597725 573 ntTSL 411.01□□□□□ -0.658e-8■□□□□ 9.3
PUM1Q14671 HNRNPU-212ENST00000638230 1922 ntTSL 511.68□□□□□ -0.542e-20■□□□□ 9.3
PUM1Q14671 HNRNPU-216ENST00000638716 2640 ntTSL 5 BASIC9.11□□□□□ -0.952e-20■□□□□ 9.3
PUM1Q14671 HNRNPU-219ENST00000639628 4546 ntTSL 1 (best) BASIC8.09□□□□□ -1.112e-20■□□□□ 9.3
PUM1Q14671 HNRNPU-222ENST00000639880 4239 ntTSL 57.92□□□□□ -1.142e-20■□□□□ 9.3
PUM1Q14671 HNRNPU-207ENST00000468690 5273 ntTSL 57.31□□□□□ -1.242e-20■□□□□ 9.3
PUM1Q14671 HNRNPU-223ENST00000640001 4227 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.252e-20■□□□□ 9.3
PUM1Q14671 HNRNPU-213ENST00000638301 3650 ntTSL 56.38□□□□□ -1.392e-20■□□□□ 9.3
PUM1Q14671 HNRNPU-221ENST00000639824 1450 ntTSL 510.68□□□□□ -0.73e-20■□□□□ 9.3
PUM1Q14671 PLK1-209ENST00000570220 910 ntTSL 318.26■□□□□ 0.513e-6■□□□□ 9.3
PUM1Q14671 PLK1-204ENST00000564202 584 ntTSL 315.4■□□□□ 0.063e-6■□□□□ 9.3
PUM1Q14671 FSCN1-205ENST00000473330 2215 ntTSL 219.53■□□□□ 0.725e-8■□□□□ 9.3
PUM1Q14671 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.519e-7■□□□□ 9.3
PUM1Q14671 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.149e-7■□□□□ 9.3
PUM1Q14671 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.149e-7■□□□□ 9.3
PUM1Q14671 CTNNA1-213ENST00000519113 859 ntTSL 321.14■□□□□ 0.979e-7■□□□□ 9.3
PUM1Q14671 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.849e-7■□□□□ 9.3
PUM1Q14671 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.739e-7■□□□□ 9.3
PUM1Q14671 CTNNA1-206ENST00000517980 696 ntTSL 418.53■□□□□ 0.569e-7■□□□□ 9.3
PUM1Q14671 CALM1-207ENST00000553964 2670 ntTSL 1 (best)18.43■□□□□ 0.549e-7■□□□□ 9.3
PUM1Q14671 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.459e-7■□□□□ 9.3
PUM1Q14671 RBM6-209ENST00000441115 1876 ntTSL 217.12■□□□□ 0.332e-6■□□□□ 9.3
PUM1Q14671 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.329e-7■□□□□ 9.3
PUM1Q14671 CALM1-216ENST00000626705 1341 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.39e-7■□□□□ 9.3
PUM1Q14671 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.279e-7■□□□□ 9.3
PUM1Q14671 CALM1-206ENST00000553630 1420 ntTSL 516.69■□□□□ 0.269e-7■□□□□ 9.3
PUM1Q14671 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.259e-7■□□□□ 9.3
PUM1Q14671 ARID4B-208ENST00000466653 2315 ntTSL 216.54■□□□□ 0.249e-7■□□□□ 9.3
PUM1Q14671 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.149e-7■□□□□ 9.3
PUM1Q14671 CTSL-206ENST00000495822 988 ntTSL 1 (best)15.93■□□□□ 0.149e-7■□□□□ 9.3
PUM1Q14671 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.059e-7■□□□□ 9.3
PUM1Q14671 GSTK1-202ENST00000409500 888 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.059e-7■□□□□ 9.3
PUM1Q14671 CTSL-204ENST00000375894 975 ntTSL 315.16■□□□□ 0.029e-7■□□□□ 9.3
PUM1Q14671 EIF3D-207ENST00000457241 729 ntTSL 214.79□□□□□ -0.042e-9■□□□□ 9.3
PUM1Q14671 CTSL-202ENST00000342020 933 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.089e-7■□□□□ 9.3
PUM1Q14671 CTSL-205ENST00000482054 908 ntTSL 214.56□□□□□ -0.089e-7■□□□□ 9.3
PUM1Q14671 TFAM-202ENST00000373899 1121 ntTSL 214.5□□□□□ -0.099e-7■□□□□ 9.3
PUM1Q14671 CTSL-201ENST00000340342 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.119e-7■□□□□ 9.3
PUM1Q14671 TFAM-204ENST00000487519 5414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.239e-7■□□□□ 9.3
PUM1Q14671 WNK1-201ENST00000315939 10452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.269e-7■□□□□ 9.3
PUM1Q14671 LRRFIP2-202ENST00000354379 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.289e-7■□□□□ 9.3
PUM1Q14671 TFAM-201ENST00000373895 973 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.39e-7■□□□□ 9.3
PUM1Q14671 CTNNA1-234ENST00000522227 642 ntTSL 313.08□□□□□ -0.329e-7■□□□□ 9.3
PUM1Q14671 GSTK1-201ENST00000358406 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.349e-7■□□□□ 9.3
PUM1Q14671 CALM1-214ENST00000557020 557 ntTSL 412.68□□□□□ -0.389e-7■□□□□ 9.3
PUM1Q14671 TMOD1-202ENST00000375175 2516 ntTSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.412e-9■□□□□ 9.3
PUM1Q14671 WBP11-205ENST00000544764 564 ntTSL 212.38□□□□□ -0.439e-7■□□□□ 9.3
PUM1Q14671 WNK1-209ENST00000537687 11232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.469e-7■□□□□ 9.3
PUM1Q14671 CTNNA1-211ENST00000518910 572 ntTSL 412.13□□□□□ -0.479e-7■□□□□ 9.3
PUM1Q14671 WNK1-202ENST00000340908 11208 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.479e-7■□□□□ 9.3
PUM1Q14671 GSTK1-205ENST00000443571 850 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.519e-7■□□□□ 9.3
PUM1Q14671 CALM1-201ENST00000356978 4242 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.549e-7■□□□□ 9.3
PUM1Q14671 GSTK1-204ENST00000442394 2219 ntTSL 511.22□□□□□ -0.619e-7■□□□□ 9.3
PUM1Q14671 GSTK1-203ENST00000436038 556 ntTSL 511.04□□□□□ -0.649e-7■□□□□ 9.3
PUM1Q14671 WNK1-204ENST00000530271 11804 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.689e-7■□□□□ 9.3
PUM1Q14671 EIF3D-205ENST00000432675 678 ntTSL 210.51□□□□□ -0.732e-9■□□□□ 9.3
PUM1Q14671 CTNNA1-221ENST00000520339 868 ntTSL 39.92□□□□□ -0.829e-7■□□□□ 9.3
PUM1Q14671 LRRFIP2-203ENST00000396428 1791 ntTSL 2 BASIC9.92□□□□□ -0.829e-7■□□□□ 9.3
PUM1Q14671 CTNNA1-215ENST00000519309 869 ntTSL 39.63□□□□□ -0.879e-7■□□□□ 9.3
PUM1Q14671 CTNNA1-240ENST00000523912 545 ntTSL 49.6□□□□□ -0.879e-7■□□□□ 9.3
PUM1Q14671 CTNNA1-230ENST00000521724 2741 ntTSL 29.08□□□□□ -0.969e-7■□□□□ 9.3
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