Protein–RNA interactions for Protein: Q14258

TRIM25, E3 ubiquitin/ISG15 ligase TRIM25, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 630 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM25Q14258 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TRIM25Q14258 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TRIM25Q14258 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TRIM25Q14258 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TRIM25Q14258 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
TRIM25Q14258 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TRIM25Q14258 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TRIM25Q14258 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TRIM25Q14258 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TRIM25Q14258 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TRIM25Q14258 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TRIM25Q14258 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TRIM25Q14258 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TRIM25Q14258 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TRIM25Q14258 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TRIM25Q14258 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TRIM25Q14258 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
TRIM25Q14258 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TRIM25Q14258 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TRIM25Q14258 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TRIM25Q14258 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TRIM25Q14258 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TRIM25Q14258 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TRIM25Q14258 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TRIM25Q14258 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TRIM25Q14258 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TRIM25Q14258 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TRIM25Q14258 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TRIM25Q14258 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TRIM25Q14258 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TRIM25Q14258 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TRIM25Q14258 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TRIM25Q14258 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TRIM25Q14258 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TRIM25Q14258 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TRIM25Q14258 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TRIM25Q14258 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TRIM25Q14258 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TRIM25Q14258 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TRIM25Q14258 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TRIM25Q14258 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TRIM25Q14258 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TRIM25Q14258 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TRIM25Q14258 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TRIM25Q14258 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TRIM25Q14258 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TRIM25Q14258 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TRIM25Q14258 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
TRIM25Q14258 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TRIM25Q14258 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TRIM25Q14258 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TRIM25Q14258 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TRIM25Q14258 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TRIM25Q14258 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TRIM25Q14258 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TRIM25Q14258 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TRIM25Q14258 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TRIM25Q14258 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TRIM25Q14258 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TRIM25Q14258 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TRIM25Q14258 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TRIM25Q14258 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TRIM25Q14258 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TRIM25Q14258 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TRIM25Q14258 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TRIM25Q14258 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TRIM25Q14258 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TRIM25Q14258 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TRIM25Q14258 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TRIM25Q14258 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TRIM25Q14258 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TRIM25Q14258 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TRIM25Q14258 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TRIM25Q14258 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TRIM25Q14258 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TRIM25Q14258 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TRIM25Q14258 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TRIM25Q14258 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
TRIM25Q14258 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TRIM25Q14258 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TRIM25Q14258 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TRIM25Q14258 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TRIM25Q14258 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TRIM25Q14258 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TRIM25Q14258 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TRIM25Q14258 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TRIM25Q14258 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TRIM25Q14258 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
TRIM25Q14258 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
TRIM25Q14258 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
TRIM25Q14258 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TRIM25Q14258 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TRIM25Q14258 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TRIM25Q14258 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TRIM25Q14258 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TRIM25Q14258 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TRIM25Q14258 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TRIM25Q14258 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TRIM25Q14258 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TRIM25Q14258 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
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