Protein–RNA interactions for Protein: Q13790

APOF, Apolipoprotein F, humanhuman

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Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOFQ13790 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
APOFQ13790 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
APOFQ13790 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
APOFQ13790 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
APOFQ13790 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
APOFQ13790 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
APOFQ13790 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
APOFQ13790 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
APOFQ13790 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
APOFQ13790 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
APOFQ13790 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
APOFQ13790 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
APOFQ13790 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
APOFQ13790 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
APOFQ13790 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
APOFQ13790 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
APOFQ13790 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
APOFQ13790 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
APOFQ13790 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
APOFQ13790 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
APOFQ13790 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
APOFQ13790 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
APOFQ13790 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
APOFQ13790 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
APOFQ13790 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
APOFQ13790 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
APOFQ13790 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
APOFQ13790 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
APOFQ13790 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
APOFQ13790 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
APOFQ13790 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
APOFQ13790 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
APOFQ13790 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
APOFQ13790 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
APOFQ13790 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
APOFQ13790 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
APOFQ13790 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
APOFQ13790 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
APOFQ13790 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
APOFQ13790 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
APOFQ13790 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
APOFQ13790 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
APOFQ13790 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
APOFQ13790 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
APOFQ13790 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
APOFQ13790 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
APOFQ13790 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
APOFQ13790 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
APOFQ13790 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
APOFQ13790 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
APOFQ13790 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
APOFQ13790 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
APOFQ13790 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
APOFQ13790 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
APOFQ13790 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
APOFQ13790 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
APOFQ13790 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC17.5■□□□□ 0.39
APOFQ13790 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
APOFQ13790 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
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APOFQ13790 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
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APOFQ13790 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
APOFQ13790 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
APOFQ13790 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
APOFQ13790 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
APOFQ13790 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
APOFQ13790 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
APOFQ13790 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
APOFQ13790 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
APOFQ13790 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
APOFQ13790 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
APOFQ13790 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
APOFQ13790 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
APOFQ13790 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
APOFQ13790 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
APOFQ13790 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
APOFQ13790 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
APOFQ13790 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
APOFQ13790 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
APOFQ13790 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
APOFQ13790 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
APOFQ13790 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
APOFQ13790 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
APOFQ13790 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
APOFQ13790 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
APOFQ13790 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
APOFQ13790 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
APOFQ13790 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
APOFQ13790 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC17.49■□□□□ 0.39
APOFQ13790 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC17.49■□□□□ 0.39
APOFQ13790 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
APOFQ13790 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
APOFQ13790 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
APOFQ13790 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
APOFQ13790 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
APOFQ13790 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
APOFQ13790 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
APOFQ13790 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
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