Protein–RNA interactions for Protein: Q13733

ATP1A4, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-4, humanhuman

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Length 1,029 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP1A4Q13733 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ATP1A4Q13733 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ATP1A4Q13733 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ATP1A4Q13733 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ATP1A4Q13733 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ATP1A4Q13733 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ATP1A4Q13733 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
ATP1A4Q13733 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
ATP1A4Q13733 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ATP1A4Q13733 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ATP1A4Q13733 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ATP1A4Q13733 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ATP1A4Q13733 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ATP1A4Q13733 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ATP1A4Q13733 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ATP1A4Q13733 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ATP1A4Q13733 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
ATP1A4Q13733 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ATP1A4Q13733 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ATP1A4Q13733 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ATP1A4Q13733 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ATP1A4Q13733 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ATP1A4Q13733 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ATP1A4Q13733 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ATP1A4Q13733 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
ATP1A4Q13733 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ATP1A4Q13733 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ATP1A4Q13733 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ATP1A4Q13733 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ATP1A4Q13733 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ATP1A4Q13733 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ATP1A4Q13733 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ATP1A4Q13733 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ATP1A4Q13733 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATP1A4Q13733 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATP1A4Q13733 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATP1A4Q13733 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATP1A4Q13733 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATP1A4Q13733 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATP1A4Q13733 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATP1A4Q13733 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATP1A4Q13733 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATP1A4Q13733 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATP1A4Q13733 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATP1A4Q13733 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
ATP1A4Q13733 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATP1A4Q13733 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
ATP1A4Q13733 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
ATP1A4Q13733 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATP1A4Q13733 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATP1A4Q13733 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATP1A4Q13733 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATP1A4Q13733 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATP1A4Q13733 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATP1A4Q13733 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
ATP1A4Q13733 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATP1A4Q13733 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATP1A4Q13733 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATP1A4Q13733 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
ATP1A4Q13733 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATP1A4Q13733 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATP1A4Q13733 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATP1A4Q13733 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATP1A4Q13733 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATP1A4Q13733 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATP1A4Q13733 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATP1A4Q13733 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATP1A4Q13733 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATP1A4Q13733 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATP1A4Q13733 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATP1A4Q13733 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATP1A4Q13733 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATP1A4Q13733 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATP1A4Q13733 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATP1A4Q13733 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
ATP1A4Q13733 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATP1A4Q13733 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATP1A4Q13733 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATP1A4Q13733 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATP1A4Q13733 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATP1A4Q13733 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATP1A4Q13733 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
ATP1A4Q13733 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATP1A4Q13733 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
ATP1A4Q13733 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATP1A4Q13733 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATP1A4Q13733 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATP1A4Q13733 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATP1A4Q13733 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATP1A4Q13733 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATP1A4Q13733 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATP1A4Q13733 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATP1A4Q13733 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATP1A4Q13733 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATP1A4Q13733 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATP1A4Q13733 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATP1A4Q13733 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATP1A4Q13733 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATP1A4Q13733 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATP1A4Q13733 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
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