Protein–RNA interactions for Protein: Q13310

PABPC4, Polyadenylate-binding protein 4, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 644 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PABPC4Q13310 PPHLN1-202ENST00000317560 1359 ntTSL 2 BASIC8.45□□□□□ -1.066e-7■■■□□ 18.7
PABPC4Q13310 PPHLN1-225ENST00000619544 1449 ntTSL 5 BASIC8.26□□□□□ -1.096e-7■■■□□ 18.7
PABPC4Q13310 PPHLN1-208ENST00000449194 1583 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.626e-7■■■□□ 18.7
PABPC4Q13310 INO80E-208ENST00000567065 883 ntTSL 318.04■□□□□ 0.487e-11■■■□□ 18.7
PABPC4Q13310 INO80E-209ENST00000567254 625 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.087e-11■■■□□ 18.7
PABPC4Q13310 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.881e-6■■■□□ 18.7
PABPC4Q13310 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.611e-6■■■□□ 18.7
PABPC4Q13310 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.795e-9■■■□□ 18.7
PABPC4Q13310 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.685e-9■■■□□ 18.7
PABPC4Q13310 MFGE8-205ENST00000558018 1989 ntTSL 218.75■□□□□ 0.595e-9■■■□□ 18.7
PABPC4Q13310 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.465e-9■■■□□ 18.7
PABPC4Q13310 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.052e-6■■■□□ 18.7
PABPC4Q13310 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.72e-6■■■□□ 18.7
PABPC4Q13310 GIT1-204ENST00000473217 3462 ntTSL 1 (best)12.85□□□□□ -0.352e-6■■■□□ 18.7
PABPC4Q13310 SBNO1-201ENST00000267176 11121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.312e-6■■■□□ 18.7
PABPC4Q13310 SBNO1-202ENST00000420886 10981 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.342e-6■■■□□ 18.7
PABPC4Q13310 AES-209ENST00000587393 1082 ntTSL 218.62■□□□□ 0.573e-9■■■□□ 18.7
PABPC4Q13310 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC23.15■■□□□ 1.38e-10■■■□□ 18.7
PABPC4Q13310 CYBA-206ENST00000566229 405 ntTSL 316.57■□□□□ 0.244e-8■■■□□ 18.7
PABPC4Q13310 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.441e-11■■■□□ 18.7
PABPC4Q13310 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.84e-7■■■□□ 18.7
PABPC4Q13310 SIGMAR1-204ENST00000461426 939 ntTSL 1 (best)31.69■■■□□ 2.664e-7■■■□□ 18.7
PABPC4Q13310 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.861e-9■■■□□ 18.7
PABPC4Q13310 TMEM219-204ENST00000566848 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.351e-9■■■□□ 18.7
PABPC4Q13310 TMEM219-202ENST00000414689 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.351e-9■■■□□ 18.7
PABPC4Q13310 TMEM219-207ENST00000570255 926 ntTSL 214.02□□□□□ -0.171e-9■■■□□ 18.7
PABPC4Q13310 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.671e-6■■■□□ 18.7
PABPC4Q13310 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.521e-6■■■□□ 18.7
PABPC4Q13310 OAZ2-202ENST00000558194 7102 ntTSL 210.08□□□□□ -0.81e-6■■■□□ 18.7
PABPC4Q13310 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.9■■■■□ 3.52e-6■■■□□ 18.7
PABPC4Q13310 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.272e-6■■■□□ 18.7
PABPC4Q13310 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.772e-6■■■□□ 18.7
PABPC4Q13310 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.781e-6■■■□□ 18.7
PABPC4Q13310 EMG1-203ENST00000611981 1223 ntTSL 215.43■□□□□ 0.065e-21■■■□□ 18.7
PABPC4Q13310 CABIN1-203ENST00000398319 7480 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.331e-6■■■□□ 18.7
PABPC4Q13310 MTHFR-204ENST00000376590 7094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.375e-21■■■□□ 18.7
PABPC4Q13310 CABIN1-201ENST00000263119 7222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.391e-6■■■□□ 18.7
PABPC4Q13310 CABIN1-204ENST00000405822 6952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.441e-6■■■□□ 18.7
PABPC4Q13310 CABIN1-214ENST00000617531 7072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.481e-6■■■□□ 18.7
PABPC4Q13310 RRP36-202ENST00000607394 528 ntTSL 26.31□□□□□ -1.44e-7■■■□□ 18.7
PABPC4Q13310 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.324e-12■■■□□ 18.7
PABPC4Q13310 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 14e-12■■■□□ 18.7
PABPC4Q13310 UPF1-210ENST00000600689 3084 ntTSL 219.93■□□□□ 0.784e-12■■■□□ 18.7
PABPC4Q13310 UPF1-204ENST00000596842 3825 ntTSL 216.77■□□□□ 0.274e-12■■■□□ 18.7
PABPC4Q13310 TMEM132D-AS1-203ENST00000512133 2271 ntTSL 1 (best)12.24□□□□□ -0.452e-13■■■□□ 18.6
PABPC4Q13310 TMEM132D-AS1-206ENST00000541320 440 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.852e-13■■■□□ 18.6
PABPC4Q13310 TMEM132D-AS1-204ENST00000537367 531 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.862e-13■■■□□ 18.6
PABPC4Q13310 TMEM132D-AS1-207ENST00000542535 442 ntTSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.912e-13■■■□□ 18.6
PABPC4Q13310 TMEM132D-AS1-202ENST00000510001 293 ntTSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.942e-13■■■□□ 18.6
PABPC4Q13310 RBM8A-201ENST00000369307 796 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.53e-8■■■□□ 18.6
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PABPC4Q13310 RBM8A-204ENST00000583313 4961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.173e-8■■■□□ 18.6
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PABPC4Q13310 ENY2-214ENST00000522766 567 ntTSL 413.44□□□□□ -0.262e-6■■■□□ 18.6
PABPC4Q13310 ENY2-208ENST00000520147 857 ntTSL 4 BASIC11.62□□□□□ -0.552e-6■■■□□ 18.6
PABPC4Q13310 ENY2-201ENST00000339942 546 ntTSL 411.47□□□□□ -0.572e-6■■■□□ 18.6
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PABPC4Q13310 ENY2-209ENST00000521619 1384 ntTSL 1 (best)6.85□□□□□ -1.312e-6■■■□□ 18.6
PABPC4Q13310 ENY2-216ENST00000523707 737 ntTSL 56.75□□□□□ -1.332e-6■■■□□ 18.6
PABPC4Q13310 ENY2-205ENST00000518118 2747 ntTSL 1 (best)2.81□□□□□ -1.962e-6■■■□□ 18.6
PABPC4Q13310 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.372e-6■■■□□ 18.6
PABPC4Q13310 TOP1MT-210ENST00000519977 892 ntTSL 319.72■□□□□ 0.753e-8■■■□□ 18.6
PABPC4Q13310 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.371e-6■■■□□ 18.6
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PABPC4Q13310 RBM23-215ENST00000555209 2278 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.51e-6■■■□□ 18.6
PABPC4Q13310 RBM23-204ENST00000399922 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.691e-6■■■□□ 18.6
PABPC4Q13310 RBM23-233ENST00000557667 4240 ntTSL 1 (best)9.46□□□□□ -0.891e-6■■■□□ 18.6
PABPC4Q13310 RBM23-203ENST00000359890 10040 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -11e-6■■■□□ 18.6
PABPC4Q13310 STIP1-207ENST00000538945 1900 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.192e-15■■■□□ 18.6
PABPC4Q13310 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.298e-7■■■□□ 18.6
PABPC4Q13310 KLF16-202ENST00000541015 1134 ntTSL 1 (best)27.02■■□□□ 1.928e-7■■■□□ 18.6
PABPC4Q13310 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.898e-7■■■□□ 18.6
PABPC4Q13310 AC048338.1-201ENST00000535844 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.461e-7■■■□□ 18.6
PABPC4Q13310 NOS3-201ENST00000297494 4388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.152e-6■■■□□ 18.6
PABPC4Q13310 COMMD9-201ENST00000263401 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.552e-6■■■□□ 18.6
PABPC4Q13310 COMMD9-207ENST00000533308 374 ntTSL 39.2□□□□□ -0.942e-6■■■□□ 18.6
PABPC4Q13310 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.445e-17■■■□□ 18.6
PABPC4Q13310 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.855e-17■■■□□ 18.6
PABPC4Q13310 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.465e-17■■■□□ 18.6
PABPC4Q13310 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.055e-17■■■□□ 18.6
PABPC4Q13310 PTPMT1-204ENST00000527079 2272 ntTSL 1 (best)11.86□□□□□ -0.515e-17■■■□□ 18.6
PABPC4Q13310 ATXN2-211ENST00000484991 793 ntTSL 28.57□□□□□ -1.043e-9■■■□□ 18.6
PABPC4Q13310 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.331e-8■■■□□ 18.6
PABPC4Q13310 FXYD5-201ENST00000342879 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.354e-17■■■□□ 18.6
PABPC4Q13310 FXYD5-204ENST00000392219 872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.394e-17■■■□□ 18.6
PABPC4Q13310 FXYD5-205ENST00000423817 892 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.54e-17■■■□□ 18.6
PABPC4Q13310 FXYD5-210ENST00000588699 927 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.574e-17■■■□□ 18.6
PABPC4Q13310 FXYD5-211ENST00000590686 862 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.654e-17■■■□□ 18.6
PABPC4Q13310 FXYD5-202ENST00000392217 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.664e-17■■■□□ 18.6
PABPC4Q13310 FXYD5-212ENST00000591716 682 ntTSL 310.8□□□□□ -0.684e-17■■■□□ 18.6
PABPC4Q13310 FXYD5-209ENST00000586925 429 ntTSL 310.8□□□□□ -0.684e-17■■■□□ 18.6
PABPC4Q13310 FXYD5-207ENST00000541435 898 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.6□□□□□ -0.874e-17■■■□□ 18.6
PABPC4Q13310 ALG8-208ENST00000526737 1674 ntTSL 517.1■□□□□ 0.332e-12■■■□□ 18.6
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