Protein–RNA interactions for Protein: Q13094

LCP2, Lymphocyte cytosolic protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 533 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LCP2Q13094 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
LCP2Q13094 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
LCP2Q13094 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
LCP2Q13094 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
LCP2Q13094 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
LCP2Q13094 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
LCP2Q13094 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
LCP2Q13094 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
LCP2Q13094 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
LCP2Q13094 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
LCP2Q13094 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
LCP2Q13094 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
LCP2Q13094 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
LCP2Q13094 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
LCP2Q13094 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
LCP2Q13094 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
LCP2Q13094 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
LCP2Q13094 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
LCP2Q13094 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
LCP2Q13094 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
LCP2Q13094 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
LCP2Q13094 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
LCP2Q13094 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
LCP2Q13094 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
LCP2Q13094 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
LCP2Q13094 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
LCP2Q13094 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
LCP2Q13094 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
LCP2Q13094 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
LCP2Q13094 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
LCP2Q13094 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
LCP2Q13094 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
LCP2Q13094 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
LCP2Q13094 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
LCP2Q13094 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
LCP2Q13094 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
LCP2Q13094 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
LCP2Q13094 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
LCP2Q13094 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
LCP2Q13094 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
LCP2Q13094 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
LCP2Q13094 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
LCP2Q13094 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
LCP2Q13094 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
LCP2Q13094 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
LCP2Q13094 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
LCP2Q13094 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
LCP2Q13094 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
LCP2Q13094 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
LCP2Q13094 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
LCP2Q13094 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
LCP2Q13094 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
LCP2Q13094 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
LCP2Q13094 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
LCP2Q13094 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
LCP2Q13094 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
LCP2Q13094 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
LCP2Q13094 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
LCP2Q13094 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
LCP2Q13094 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
LCP2Q13094 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
LCP2Q13094 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
LCP2Q13094 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
LCP2Q13094 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
LCP2Q13094 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
LCP2Q13094 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
LCP2Q13094 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
LCP2Q13094 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
LCP2Q13094 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
LCP2Q13094 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
LCP2Q13094 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
LCP2Q13094 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
LCP2Q13094 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
LCP2Q13094 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
LCP2Q13094 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
LCP2Q13094 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
LCP2Q13094 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
LCP2Q13094 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
LCP2Q13094 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
LCP2Q13094 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
LCP2Q13094 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
LCP2Q13094 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
LCP2Q13094 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
LCP2Q13094 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
LCP2Q13094 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
LCP2Q13094 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
LCP2Q13094 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
LCP2Q13094 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
LCP2Q13094 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
LCP2Q13094 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
LCP2Q13094 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
LCP2Q13094 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
LCP2Q13094 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
LCP2Q13094 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
LCP2Q13094 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
LCP2Q13094 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
LCP2Q13094 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
LCP2Q13094 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
LCP2Q13094 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
LCP2Q13094 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms