Protein–RNA interactions for Protein: Q12906

ILF3, Interleukin enhancer-binding factor 3, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 894 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ILF3Q12906 AIG1-204ENST00000367601 727 ntTSL 512.4□□□□□ -0.421e-7■■■□□ 15.2
ILF3Q12906 AIG1-205ENST00000447498 444 ntTSL 512.06□□□□□ -0.481e-7■■■□□ 15.2
ILF3Q12906 AIG1-202ENST00000357847 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.881e-7■■■□□ 15.2
ILF3Q12906 AIG1-201ENST00000275235 1202 ntTSL 2 BASIC8.62□□□□□ -1.031e-7■■■□□ 15.2
ILF3Q12906 AIG1-206ENST00000458219 593 ntTSL 26.76□□□□□ -1.331e-7■■■□□ 15.2
ILF3Q12906 AL035458.2-201ENST00000512005 478 ntTSL 3 BASIC6.85□□□□□ -1.316e-6■■■□□ 15.2
ILF3Q12906 HNRNPC-205ENST00000553300 1375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.312e-7■■■□□ 15.2
ILF3Q12906 HNRNPC-221ENST00000555883 1182 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.382e-7■■■□□ 15.2
ILF3Q12906 HNRNPC-202ENST00000420743 1559 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.512e-7■■■□□ 15.2
ILF3Q12906 HNRNPC-214ENST00000554969 1924 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.72e-7■■■□□ 15.2
ILF3Q12906 HNRNPC-230ENST00000557201 1371 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.72e-7■■■□□ 15.2
ILF3Q12906 HNRNPC-213ENST00000554891 644 ntTSL 510.54□□□□□ -0.722e-7■■■□□ 15.2
ILF3Q12906 HNRNPC-232ENST00000557442 1308 ntTSL 210.49□□□□□ -0.732e-7■■■□□ 15.2
ILF3Q12906 HNRNPC-225ENST00000556513 1403 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.772e-7■■■□□ 15.2
ILF3Q12906 HNRNPC-208ENST00000553753 1790 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.792e-7■■■□□ 15.2
ILF3Q12906 HNRNPC-218ENST00000555215 781 ntTSL 510.04□□□□□ -0.82e-7■■■□□ 15.2
ILF3Q12906 HNRNPC-209ENST00000554383 1039 ntTSL 510.04□□□□□ -0.82e-7■■■□□ 15.2
ILF3Q12906 HNRNPC-219ENST00000555309 1714 ntTSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.822e-7■■■□□ 15.2
ILF3Q12906 HNRNPC-216ENST00000555137 789 ntTSL 39.63□□□□□ -0.872e-7■■■□□ 15.2
ILF3Q12906 HNRNPC-223ENST00000556142 1599 ntTSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.962e-7■■■□□ 15.2
ILF3Q12906 HNRNPC-222ENST00000555914 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.81□□□□□ -12e-7■■■□□ 15.2
ILF3Q12906 HNRNPC-212ENST00000554539 748 ntTSL 58.51□□□□□ -1.052e-7■■■□□ 15.2
ILF3Q12906 HNRNPC-211ENST00000554455 1784 ntTSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.062e-7■■■□□ 15.2
ILF3Q12906 HNRNPC-201ENST00000336053 3301 ntTSL 2 BASIC8.19□□□□□ -1.12e-7■■■□□ 15.2
ILF3Q12906 HNRNPC-226ENST00000556628 1156 ntTSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.182e-7■■■□□ 15.2
ILF3Q12906 FCHSD2-204ENST00000409418 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.173e-6■■■□□ 15.2
ILF3Q12906 FCHSD2-203ENST00000409314 4509 ntTSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.273e-6■■■□□ 15.2
ILF3Q12906 FCHSD2-208ENST00000458644 2215 ntTSL 2 BASIC6.11□□□□□ -1.433e-6■■■□□ 15.2
ILF3Q12906 FCHSD2-201ENST00000311172 4340 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.463e-6■■■□□ 15.2
ILF3Q12906 FCHSD2-205ENST00000409853 1867 ntTSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.723e-6■■■□□ 15.2
ILF3Q12906 NFAT5-209ENST00000567239 6376 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.472e-6■■■□□ 15.2
ILF3Q12906 NFAT5-208ENST00000566899 4914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.08□□□□□ -1.122e-6■■■□□ 15.2
ILF3Q12906 NFAT5-204ENST00000426654 14219 ntTSL 1 (best)7.72□□□□□ -1.171e-8■■■□□ 15.2
ILF3Q12906 NFAT5-201ENST00000349945 13362 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.211e-8■■■□□ 15.2
ILF3Q12906 NFAT5-202ENST00000354436 13229 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.241e-8■■■□□ 15.2
ILF3Q12906 NFAT5-212ENST00000627621 5875 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.462e-6■■■□□ 15.2
ILF3Q12906 NFAT5-203ENST00000393742 13067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.721e-8■■■□□ 15.2
ILF3Q12906 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.256e-7■■■□□ 15.1
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ILF3Q12906 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.562e-9■■■□□ 15.1
ILF3Q12906 FKBP8-202ENST00000544835 1292 ntTSL 1 (best)17.87■□□□□ 0.452e-9■■■□□ 15.1
ILF3Q12906 FKBP8-211ENST00000601844 1548 ntTSL 517.06■□□□□ 0.322e-9■■■□□ 15.1
ILF3Q12906 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.112e-9■■■□□ 15.1
ILF3Q12906 NOP58-201ENST00000264279 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.263e-6■■■□□ 15.1
ILF3Q12906 NOP58-209ENST00000492688 571 ntTSL 44.03□□□□□ -1.763e-6■■■□□ 15.1
ILF3Q12906 PCBP2-221ENST00000551104 681 ntTSL 38.37□□□□□ -1.075e-13■■■□□ 15.1
ILF3Q12906 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.355e-8■■■□□ 15.1
ILF3Q12906 CHKA-206ENST00000531341 524 ntTSL 321.03■□□□□ 0.965e-8■■■□□ 15.1
ILF3Q12906 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.145e-8■■■□□ 15.1
ILF3Q12906 HECTD1-202ENST00000553616 570 ntTSL 24.91□□□□□ -1.621e-6■■■□□ 15.1
ILF3Q12906 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.61e-6■■■□□ 15.1
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ILF3Q12906 PTPRA-207ENST00000431048 707 ntTSL 522.12■■□□□ 1.133e-10■■■□□ 15.1
ILF3Q12906 PTPRA-206ENST00000430705 733 ntTSL 516.2■□□□□ 0.183e-10■■■□□ 15.1
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ILF3Q12906 FAM168B-202ENST00000409185 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.361e-6■■■□□ 15.1
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ILF3Q12906 PTPRA-202ENST00000318266 3219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.79□□□□□ -13e-10■■■□□ 15.1
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ILF3Q12906 WDR33-204ENST00000409658 3104 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.667e-7■■■□□ 15.1
ILF3Q12906 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.182e-6■■■□□ 15.1
ILF3Q12906 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.112e-6■■■□□ 15.1
ILF3Q12906 QRICH1-204ENST00000424300 3009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.52e-6■■■□□ 15.1
ILF3Q12906 GTF3C2-204ENST00000423998 828 ntTSL 513.72□□□□□ -0.214e-9■■■□□ 15.1
ILF3Q12906 GTF3C2-208ENST00000457748 557 ntTSL 512.26□□□□□ -0.454e-9■■■□□ 15.1
ILF3Q12906 GTF3C2-201ENST00000264720 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.814e-9■■■□□ 15.1
ILF3Q12906 GTF3C2-202ENST00000359541 3992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.014e-9■■■□□ 15.1
ILF3Q12906 IGF1R-210ENST00000559925 2280 ntTSL 1 (best)13.61□□□□□ -0.231e-6■■■□□ 15.1
ILF3Q12906 IGF1R-204ENST00000558355 572 ntTSL 211.22□□□□□ -0.611e-6■■■□□ 15.1
ILF3Q12906 IGF1R-201ENST00000268035 11803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.771e-6■■■□□ 15.1
ILF3Q12906 IGF1R-203ENST00000557938 574 ntTSL 49.85□□□□□ -0.831e-6■■■□□ 15.1
ILF3Q12906 IGF1R-206ENST00000558762 11726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.18□□□□□ -1.11e-6■■■□□ 15.1
ILF3Q12906 ERBIN-212ENST00000508515 4374 ntTSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.898e-7■■■□□ 15.1
ILF3Q12906 NSMCE2-201ENST00000287437 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.692e-9■■■□□ 15.1
ILF3Q12906 NSMCE2-203ENST00000517532 841 ntTSL 59.48□□□□□ -0.892e-9■■■□□ 15.1
ILF3Q12906 NSMCE2-202ENST00000517315 996 ntTSL 3 BASIC5.66□□□□□ -1.52e-9■■■□□ 15.1
ILF3Q12906 NSMCE2-210ENST00000522563 1037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.52e-9■■■□□ 15.1
ILF3Q12906 DCP2-204ENST00000508359 838 ntTSL 25.48□□□□□ -1.534e-7■■■□□ 15.1
ILF3Q12906 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.013e-10■■■□□ 15.1
ILF3Q12906 SUN1-222ENST00000457861 2975 ntTSL 214.55□□□□□ -0.083e-10■■■□□ 15.1
ILF3Q12906 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.268e-7■■■□□ 15
ILF3Q12906 SMPD4-207ENST00000435455 842 ntTSL 516.16■□□□□ 0.188e-7■■■□□ 15
ILF3Q12906 SMPD4-204ENST00000430682 820 ntTSL 312.41□□□□□ -0.428e-7■■■□□ 15
ILF3Q12906 SMPD4-212ENST00000451542 796 ntTSL 511.99□□□□□ -0.498e-7■■■□□ 15
ILF3Q12906 SMPD4-217ENST00000473720 555 ntTSL 411.93□□□□□ -0.58e-7■■■□□ 15
ILF3Q12906 SMPD4-213ENST00000454468 3586 ntTSL 1 (best)11.31□□□□□ -0.68e-7■■■□□ 15
ILF3Q12906 SMPD4-205ENST00000431183 3614 ntTSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.668e-7■■■□□ 15
ILF3Q12906 SMPD4-209ENST00000439886 3371 ntTSL 210.77□□□□□ -0.688e-7■■■□□ 15
ILF3Q12906 SMPD4-201ENST00000351288 3661 ntTSL 2 BASIC9.93□□□□□ -0.828e-7■■■□□ 15
ILF3Q12906 SMPD4-208ENST00000439029 566 ntTSL 49.75□□□□□ -0.858e-7■■■□□ 15
ILF3Q12906 SMPD4-206ENST00000433118 3335 ntTSL 59.73□□□□□ -0.858e-7■■■□□ 15
ILF3Q12906 SMPD4-203ENST00000412570 3601 ntTSL 29.42□□□□□ -0.98e-7■■■□□ 15
ILF3Q12906 DNAJC6-206ENST00000483402 409 ntTSL 35.99□□□□□ -1.454e-10■■■□□ 15
ILF3Q12906 DNAJC6-204ENST00000463018 546 ntTSL 35.69□□□□□ -1.54e-10■■■□□ 15
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