Protein–RNA interactions for Protein: Q02742

GCNT1, Beta-1,3-galactosyl-O-glycosyl-glycoprotein beta-1,6-N-acetylglucosaminyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCNT1Q02742 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
GCNT1Q02742 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
GCNT1Q02742 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
GCNT1Q02742 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GCNT1Q02742 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GCNT1Q02742 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GCNT1Q02742 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GCNT1Q02742 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GCNT1Q02742 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GCNT1Q02742 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GCNT1Q02742 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GCNT1Q02742 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GCNT1Q02742 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GCNT1Q02742 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GCNT1Q02742 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GCNT1Q02742 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GCNT1Q02742 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
GCNT1Q02742 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GCNT1Q02742 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GCNT1Q02742 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GCNT1Q02742 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GCNT1Q02742 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GCNT1Q02742 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GCNT1Q02742 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GCNT1Q02742 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GCNT1Q02742 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GCNT1Q02742 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GCNT1Q02742 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GCNT1Q02742 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GCNT1Q02742 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GCNT1Q02742 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GCNT1Q02742 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GCNT1Q02742 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GCNT1Q02742 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GCNT1Q02742 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GCNT1Q02742 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GCNT1Q02742 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GCNT1Q02742 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GCNT1Q02742 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GCNT1Q02742 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GCNT1Q02742 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GCNT1Q02742 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GCNT1Q02742 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GCNT1Q02742 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
GCNT1Q02742 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
GCNT1Q02742 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GCNT1Q02742 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GCNT1Q02742 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GCNT1Q02742 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GCNT1Q02742 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GCNT1Q02742 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GCNT1Q02742 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GCNT1Q02742 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GCNT1Q02742 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GCNT1Q02742 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GCNT1Q02742 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GCNT1Q02742 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
GCNT1Q02742 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GCNT1Q02742 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GCNT1Q02742 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
GCNT1Q02742 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GCNT1Q02742 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
GCNT1Q02742 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
GCNT1Q02742 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
GCNT1Q02742 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GCNT1Q02742 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GCNT1Q02742 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GCNT1Q02742 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GCNT1Q02742 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GCNT1Q02742 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GCNT1Q02742 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GCNT1Q02742 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GCNT1Q02742 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GCNT1Q02742 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GCNT1Q02742 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GCNT1Q02742 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GCNT1Q02742 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GCNT1Q02742 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GCNT1Q02742 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
GCNT1Q02742 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GCNT1Q02742 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GCNT1Q02742 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GCNT1Q02742 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GCNT1Q02742 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GCNT1Q02742 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GCNT1Q02742 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GCNT1Q02742 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GCNT1Q02742 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GCNT1Q02742 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GCNT1Q02742 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GCNT1Q02742 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GCNT1Q02742 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GCNT1Q02742 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GCNT1Q02742 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
GCNT1Q02742 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GCNT1Q02742 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GCNT1Q02742 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GCNT1Q02742 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GCNT1Q02742 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GCNT1Q02742 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms