Protein–RNA interactions for Protein: P54709

ATP1B3, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP1B3P54709 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATP1B3P54709 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATP1B3P54709 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATP1B3P54709 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATP1B3P54709 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATP1B3P54709 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATP1B3P54709 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATP1B3P54709 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATP1B3P54709 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATP1B3P54709 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATP1B3P54709 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATP1B3P54709 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATP1B3P54709 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATP1B3P54709 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATP1B3P54709 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATP1B3P54709 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATP1B3P54709 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATP1B3P54709 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATP1B3P54709 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATP1B3P54709 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATP1B3P54709 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATP1B3P54709 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATP1B3P54709 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATP1B3P54709 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATP1B3P54709 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATP1B3P54709 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATP1B3P54709 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATP1B3P54709 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATP1B3P54709 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATP1B3P54709 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATP1B3P54709 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATP1B3P54709 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATP1B3P54709 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATP1B3P54709 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATP1B3P54709 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATP1B3P54709 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATP1B3P54709 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
ATP1B3P54709 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATP1B3P54709 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
ATP1B3P54709 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATP1B3P54709 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATP1B3P54709 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
ATP1B3P54709 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATP1B3P54709 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATP1B3P54709 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATP1B3P54709 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATP1B3P54709 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATP1B3P54709 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATP1B3P54709 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATP1B3P54709 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATP1B3P54709 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATP1B3P54709 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATP1B3P54709 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATP1B3P54709 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATP1B3P54709 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATP1B3P54709 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATP1B3P54709 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATP1B3P54709 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATP1B3P54709 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATP1B3P54709 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
ATP1B3P54709 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATP1B3P54709 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATP1B3P54709 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATP1B3P54709 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATP1B3P54709 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATP1B3P54709 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATP1B3P54709 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATP1B3P54709 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATP1B3P54709 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATP1B3P54709 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATP1B3P54709 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATP1B3P54709 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
ATP1B3P54709 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATP1B3P54709 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATP1B3P54709 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
ATP1B3P54709 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATP1B3P54709 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATP1B3P54709 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATP1B3P54709 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATP1B3P54709 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATP1B3P54709 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATP1B3P54709 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATP1B3P54709 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATP1B3P54709 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATP1B3P54709 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
ATP1B3P54709 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATP1B3P54709 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATP1B3P54709 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATP1B3P54709 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATP1B3P54709 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATP1B3P54709 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATP1B3P54709 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATP1B3P54709 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
ATP1B3P54709 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATP1B3P54709 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATP1B3P54709 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATP1B3P54709 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATP1B3P54709 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATP1B3P54709 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATP1B3P54709 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms