Protein–RNA interactions for Protein: P49848

TAF6, Transcription initiation factor TFIID subunit 6, humanhuman

Predictions only

Length 677 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF6P49848 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TAF6P49848 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TAF6P49848 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TAF6P49848 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TAF6P49848 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TAF6P49848 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TAF6P49848 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TAF6P49848 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
TAF6P49848 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TAF6P49848 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TAF6P49848 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TAF6P49848 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
TAF6P49848 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TAF6P49848 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TAF6P49848 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TAF6P49848 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TAF6P49848 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TAF6P49848 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TAF6P49848 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TAF6P49848 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TAF6P49848 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TAF6P49848 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TAF6P49848 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TAF6P49848 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
TAF6P49848 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TAF6P49848 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TAF6P49848 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TAF6P49848 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TAF6P49848 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TAF6P49848 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
TAF6P49848 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TAF6P49848 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TAF6P49848 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TAF6P49848 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TAF6P49848 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TAF6P49848 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TAF6P49848 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TAF6P49848 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TAF6P49848 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TAF6P49848 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TAF6P49848 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TAF6P49848 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TAF6P49848 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TAF6P49848 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TAF6P49848 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TAF6P49848 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TAF6P49848 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TAF6P49848 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TAF6P49848 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TAF6P49848 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TAF6P49848 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TAF6P49848 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
TAF6P49848 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TAF6P49848 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TAF6P49848 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TAF6P49848 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TAF6P49848 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TAF6P49848 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TAF6P49848 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TAF6P49848 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TAF6P49848 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TAF6P49848 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TAF6P49848 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TAF6P49848 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TAF6P49848 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TAF6P49848 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TAF6P49848 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TAF6P49848 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TAF6P49848 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TAF6P49848 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
TAF6P49848 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TAF6P49848 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TAF6P49848 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TAF6P49848 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TAF6P49848 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TAF6P49848 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TAF6P49848 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TAF6P49848 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TAF6P49848 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TAF6P49848 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TAF6P49848 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TAF6P49848 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TAF6P49848 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TAF6P49848 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
TAF6P49848 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TAF6P49848 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TAF6P49848 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TAF6P49848 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TAF6P49848 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TAF6P49848 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TAF6P49848 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TAF6P49848 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TAF6P49848 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TAF6P49848 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TAF6P49848 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TAF6P49848 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TAF6P49848 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TAF6P49848 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TAF6P49848 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TAF6P49848 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms