Protein–RNA interactions for Protein: P49639

HOXA1, Homeobox protein Hox-A1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 335 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA1P49639 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
HOXA1P49639 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
HOXA1P49639 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
HOXA1P49639 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
HOXA1P49639 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
HOXA1P49639 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
HOXA1P49639 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
HOXA1P49639 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
HOXA1P49639 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
HOXA1P49639 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HOXA1P49639 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HOXA1P49639 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HOXA1P49639 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HOXA1P49639 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HOXA1P49639 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HOXA1P49639 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HOXA1P49639 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HOXA1P49639 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HOXA1P49639 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HOXA1P49639 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
HOXA1P49639 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
HOXA1P49639 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HOXA1P49639 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
HOXA1P49639 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HOXA1P49639 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HOXA1P49639 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HOXA1P49639 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HOXA1P49639 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HOXA1P49639 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HOXA1P49639 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HOXA1P49639 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HOXA1P49639 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
HOXA1P49639 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HOXA1P49639 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HOXA1P49639 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HOXA1P49639 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXA1P49639 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXA1P49639 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXA1P49639 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXA1P49639 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXA1P49639 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXA1P49639 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXA1P49639 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXA1P49639 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXA1P49639 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXA1P49639 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXA1P49639 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXA1P49639 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXA1P49639 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXA1P49639 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXA1P49639 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXA1P49639 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXA1P49639 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXA1P49639 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXA1P49639 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXA1P49639 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXA1P49639 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXA1P49639 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXA1P49639 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXA1P49639 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXA1P49639 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXA1P49639 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXA1P49639 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXA1P49639 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXA1P49639 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXA1P49639 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXA1P49639 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXA1P49639 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXA1P49639 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXA1P49639 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXA1P49639 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXA1P49639 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXA1P49639 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXA1P49639 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXA1P49639 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXA1P49639 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXA1P49639 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXA1P49639 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXA1P49639 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXA1P49639 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXA1P49639 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXA1P49639 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXA1P49639 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXA1P49639 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXA1P49639 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXA1P49639 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXA1P49639 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXA1P49639 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXA1P49639 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXA1P49639 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXA1P49639 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXA1P49639 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXA1P49639 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXA1P49639 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXA1P49639 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXA1P49639 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXA1P49639 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXA1P49639 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXA1P49639 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXA1P49639 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.6 ms