Protein–RNA interactions for Protein: P49458

SRP9, Signal recognition particle 9 kDa protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 86 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRP9P49458 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SRP9P49458 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SRP9P49458 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SRP9P49458 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SRP9P49458 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SRP9P49458 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SRP9P49458 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SRP9P49458 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SRP9P49458 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
SRP9P49458 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SRP9P49458 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SRP9P49458 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SRP9P49458 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SRP9P49458 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SRP9P49458 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SRP9P49458 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SRP9P49458 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SRP9P49458 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SRP9P49458 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SRP9P49458 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SRP9P49458 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SRP9P49458 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SRP9P49458 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SRP9P49458 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SRP9P49458 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SRP9P49458 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SRP9P49458 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SRP9P49458 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SRP9P49458 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SRP9P49458 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SRP9P49458 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SRP9P49458 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
SRP9P49458 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SRP9P49458 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SRP9P49458 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SRP9P49458 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SRP9P49458 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SRP9P49458 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SRP9P49458 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SRP9P49458 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SRP9P49458 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SRP9P49458 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SRP9P49458 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SRP9P49458 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SRP9P49458 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SRP9P49458 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SRP9P49458 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SRP9P49458 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SRP9P49458 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SRP9P49458 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SRP9P49458 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SRP9P49458 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SRP9P49458 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SRP9P49458 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SRP9P49458 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SRP9P49458 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SRP9P49458 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SRP9P49458 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SRP9P49458 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SRP9P49458 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SRP9P49458 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
SRP9P49458 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SRP9P49458 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SRP9P49458 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SRP9P49458 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SRP9P49458 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SRP9P49458 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SRP9P49458 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SRP9P49458 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SRP9P49458 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SRP9P49458 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SRP9P49458 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SRP9P49458 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
SRP9P49458 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SRP9P49458 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SRP9P49458 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SRP9P49458 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SRP9P49458 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SRP9P49458 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
SRP9P49458 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SRP9P49458 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SRP9P49458 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SRP9P49458 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SRP9P49458 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
SRP9P49458 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
SRP9P49458 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
SRP9P49458 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SRP9P49458 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SRP9P49458 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SRP9P49458 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SRP9P49458 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SRP9P49458 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SRP9P49458 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
SRP9P49458 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SRP9P49458 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SRP9P49458 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SRP9P49458 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SRP9P49458 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SRP9P49458 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SRP9P49458 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.1 ms