Protein–RNA interactions for Protein: P49368

CCT3, T-complex protein 1 subunit gamma, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 545 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCT3P49368 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCT3P49368 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCT3P49368 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCT3P49368 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCT3P49368 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCT3P49368 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCT3P49368 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCT3P49368 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
CCT3P49368 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
CCT3P49368 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCT3P49368 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCT3P49368 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCT3P49368 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCT3P49368 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCT3P49368 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCT3P49368 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCT3P49368 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCT3P49368 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCT3P49368 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCT3P49368 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCT3P49368 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCT3P49368 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCT3P49368 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCT3P49368 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCT3P49368 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCT3P49368 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCT3P49368 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCT3P49368 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCT3P49368 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCT3P49368 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCT3P49368 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
CCT3P49368 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCT3P49368 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
CCT3P49368 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCT3P49368 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCT3P49368 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCT3P49368 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCT3P49368 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCT3P49368 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCT3P49368 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCT3P49368 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCT3P49368 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCT3P49368 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCT3P49368 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCT3P49368 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCT3P49368 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCT3P49368 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCT3P49368 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCT3P49368 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCT3P49368 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCT3P49368 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCT3P49368 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCT3P49368 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCT3P49368 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCT3P49368 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCT3P49368 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCT3P49368 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCT3P49368 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCT3P49368 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCT3P49368 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCT3P49368 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCT3P49368 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCT3P49368 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
CCT3P49368 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCT3P49368 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCT3P49368 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCT3P49368 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCT3P49368 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCT3P49368 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCT3P49368 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCT3P49368 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCT3P49368 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCT3P49368 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCT3P49368 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
CCT3P49368 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCT3P49368 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCT3P49368 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCT3P49368 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCT3P49368 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCT3P49368 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCT3P49368 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCT3P49368 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCT3P49368 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCT3P49368 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCT3P49368 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCT3P49368 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCT3P49368 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCT3P49368 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCT3P49368 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCT3P49368 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCT3P49368 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCT3P49368 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCT3P49368 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCT3P49368 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCT3P49368 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCT3P49368 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCT3P49368 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCT3P49368 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCT3P49368 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCT3P49368 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms