Protein–RNA interactions for Protein: P37840

SNCA, Alpha-synuclein, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNCAP37840 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNCAP37840 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SNCAP37840 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNCAP37840 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNCAP37840 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNCAP37840 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNCAP37840 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNCAP37840 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNCAP37840 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNCAP37840 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNCAP37840 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNCAP37840 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNCAP37840 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNCAP37840 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNCAP37840 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNCAP37840 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNCAP37840 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNCAP37840 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNCAP37840 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNCAP37840 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNCAP37840 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNCAP37840 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNCAP37840 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNCAP37840 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNCAP37840 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNCAP37840 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNCAP37840 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNCAP37840 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNCAP37840 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNCAP37840 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNCAP37840 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNCAP37840 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNCAP37840 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNCAP37840 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNCAP37840 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SNCAP37840 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNCAP37840 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNCAP37840 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNCAP37840 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNCAP37840 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNCAP37840 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNCAP37840 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNCAP37840 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNCAP37840 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNCAP37840 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNCAP37840 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNCAP37840 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNCAP37840 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNCAP37840 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNCAP37840 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNCAP37840 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNCAP37840 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNCAP37840 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNCAP37840 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNCAP37840 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNCAP37840 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNCAP37840 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNCAP37840 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNCAP37840 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNCAP37840 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNCAP37840 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNCAP37840 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNCAP37840 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNCAP37840 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNCAP37840 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNCAP37840 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNCAP37840 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNCAP37840 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNCAP37840 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNCAP37840 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SNCAP37840 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNCAP37840 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNCAP37840 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SNCAP37840 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNCAP37840 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SNCAP37840 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNCAP37840 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNCAP37840 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNCAP37840 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNCAP37840 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNCAP37840 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNCAP37840 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNCAP37840 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNCAP37840 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNCAP37840 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNCAP37840 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNCAP37840 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNCAP37840 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNCAP37840 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNCAP37840 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNCAP37840 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNCAP37840 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNCAP37840 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SNCAP37840 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNCAP37840 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNCAP37840 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNCAP37840 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNCAP37840 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNCAP37840 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNCAP37840 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms