Protein–RNA interactions for Protein: P30613

PKLR, Pyruvate kinase PKLR, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKLRP30613 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PKLRP30613 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PKLRP30613 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PKLRP30613 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PKLRP30613 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PKLRP30613 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PKLRP30613 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PKLRP30613 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PKLRP30613 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PKLRP30613 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
PKLRP30613 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PKLRP30613 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PKLRP30613 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PKLRP30613 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PKLRP30613 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PKLRP30613 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PKLRP30613 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PKLRP30613 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PKLRP30613 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PKLRP30613 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
PKLRP30613 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PKLRP30613 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PKLRP30613 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PKLRP30613 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PKLRP30613 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PKLRP30613 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PKLRP30613 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PKLRP30613 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PKLRP30613 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PKLRP30613 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PKLRP30613 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PKLRP30613 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PKLRP30613 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PKLRP30613 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PKLRP30613 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PKLRP30613 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PKLRP30613 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PKLRP30613 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PKLRP30613 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PKLRP30613 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PKLRP30613 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PKLRP30613 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PKLRP30613 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PKLRP30613 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PKLRP30613 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PKLRP30613 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PKLRP30613 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PKLRP30613 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PKLRP30613 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PKLRP30613 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PKLRP30613 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PKLRP30613 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PKLRP30613 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PKLRP30613 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PKLRP30613 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PKLRP30613 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PKLRP30613 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
PKLRP30613 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
PKLRP30613 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PKLRP30613 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PKLRP30613 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PKLRP30613 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PKLRP30613 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PKLRP30613 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PKLRP30613 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PKLRP30613 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PKLRP30613 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PKLRP30613 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PKLRP30613 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PKLRP30613 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PKLRP30613 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PKLRP30613 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PKLRP30613 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PKLRP30613 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PKLRP30613 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PKLRP30613 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PKLRP30613 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PKLRP30613 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PKLRP30613 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PKLRP30613 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PKLRP30613 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PKLRP30613 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
PKLRP30613 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PKLRP30613 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PKLRP30613 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
PKLRP30613 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PKLRP30613 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PKLRP30613 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PKLRP30613 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PKLRP30613 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PKLRP30613 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PKLRP30613 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PKLRP30613 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
PKLRP30613 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
PKLRP30613 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PKLRP30613 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PKLRP30613 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PKLRP30613 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PKLRP30613 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PKLRP30613 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms